發(fā)明領(lǐng)域本公開總體上涉及基因編輯和/或重編程的哺乳動物細(xì)胞及其用途。以電子方式提交序列表的引用本技術(shù)包括以電子方式提交的序列表。電子序列表(069296.9wo1?sequencelisitng.xml；大小：1,857,418字節(jié)；以及創(chuàng)建日期：2024年3月29日)的內(nèi)容通過引用整體并入本文。發(fā)明背景目前，對于開發(fā)大象組織培養(yǎng)、非人細(xì)胞的基因組編輯和有助于動物保護(hù)努力以及動物反滅絕努力的生物工具方面存在尚未滿足的需要。合成生物學(xué)和基因編輯可以改善對野生動物疾病的治療，糾正由氣候變化、污染、人類消費(fèi)、獵捕、人為干擾、資源耗竭、森林開伐和滅絕事件引起的生態(tài)失衡。來自瀕危物種和滅絕物種的組織和細(xì)胞系的建立和生物樣本存儲(biobanking)可以保存它們用于未來的研究，并且可以幫助重新繁殖瀕危物種和滅絕物種。然而，目前缺少用于已滅絕動物的反滅絕過程的組織和細(xì)胞系。發(fā)明的簡要概述本文提供了分離的核酸序列，其包含與以下中的至少一種具有至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％或至少99％同一性的核苷酸序列：g蛋白偶聯(lián)受體98(gpr98)(seq?id?no：1)、微管肌動蛋白交聯(lián)因子1(macf1)(seq?idno：2)、腺苷脫氨酶rna特異性b2(adarb2)(seq?id?no：3)、中心體蛋白290(cep290)(seq?idno：4)、角蛋白4(krt4)(seq?id?no：5)、loc126076011(seq?id?no：6)、nck相關(guān)蛋白5(nckap5)(seq?id?no：7)、層粘連蛋白β?4亞基(lamb4)(seq?id?no：8)、尼曼-匹克c1樣蛋白1(npc1l1)(seq?id?no：9)、粘附類g蛋白偶聯(lián)受體d2(adgrd2)(seq?id?no：10)、神經(jīng)損傷誘導(dǎo)蛋白(ninjurin)1(ninj1)(seq?id?no：11)、ahnak核蛋白2(ahnak2)(seq?id?no：12)、陽離子通道精子相關(guān)輔助亞基β(catsperb)(seq?id?no：13)、pecanex樣蛋白4(pcnxl4)(seqid?no：14)、含血影蛋白重復(fù)序列的核膜蛋白2(syne2)(seq?id?no：15)、nlr家族含pyrin結(jié)構(gòu)域的蛋白12(nlrp12)(seq?id?no：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wd重復(fù)結(jié)構(gòu)域90(wdr90)(seq?id?no：18)、乳腺癌2號(brca2)(seq?id?no：19)、蛋白激酶、dna活化催化亞基(prkdc)(seq?id?no：20)、液泡蛋白分選13同源物b(vps13b)(seq?id?no：21)、鞘脂激活蛋白原(psap)(seq?id?no：22)、sec31同源物b(sec31b)(seq?id?no：23)、角蛋白28(krt28)(seq?id?no：24)、角蛋白35(krt35)(seq?id?no：25)、角蛋白40(krt40)(seq?id?no：26)、肌球蛋白重鏈4(myh4)(seq?id?no：27)、trp的磷酸肌醇相互作用調(diào)節(jié)因子(pirt)(seq?idno：28)、多囊蛋白1樣蛋白2(pkd1l2)(seq?id?no：29)、視網(wǎng)膜色素變性1樣蛋白(rp1l1)(seq?id?no：30)、x染色體開放閱讀框58(cxorf58)(seq?id?no：31)、loc126068772(seq?idno：32)、loc126069872(seq?id?no：33)、甲狀腺激素受體相關(guān)蛋白3(thrap3)(seq?id?no：34)、著絲粒蛋白c1(cenpc1)(seq?id?no：35)、牙本質(zhì)生成和牙本質(zhì)涎磷蛋白(dspp)(seqid?no：36)、成纖維細(xì)胞生長因子5(fgf5)(seq?id?no：37)、陽離子通道精子相關(guān)輔助亞基γ(catsperg)(seq?id?no：38)、肌球蛋白重鏈1(myh1)(seq?id?no：39)、肌球蛋白重鏈13(myh13)(seq?id?no：40)、atr相互作用蛋白(atrip)(seq?id?no：41)和轉(zhuǎn)谷氨酰胺酶3(tgm3)(seq?id?no：42)。在某些實(shí)施方案中，核苷酸序列包含以下中的至少一種：gpr98(seq?id?no：1)、macf1(seq?id?no：2)、adarb2(seq?id?no：3)、cep290(seq?id?no：4)、krt4(seq?id?no：5)、loc126076011(seq?id?no：6)、nckap5(seq?id?no：7)、lamb4(seq?id?no：8)、npc1l1(seqid?no：9)、adgrd2(seq?id?no：10)、ninj1(seq?id?no：11)、ahnak2(seq?id?no：12)、catsperb(seq?id?no：13)、pcnxl4(seq?id?no：14)、syne2(seq?id?no：15)、nlrp12(seq?idno：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wdr90(seq?id?no：18)、brca2(seq?id?no：19)、prkdc(seq?id?no：20)、vps13b(seq?id?no：21)、psap(seq?id?no：22)、sec31b(seq?id?no：23)、krt28(seq?id?no：24)、krt35(seq?id?no：25)、krt40(seq?id?no：26)、myh4(seq?idno：27)、pirt(seq?id?no：28)、pkd1l2(seq?id?no：29)、rp1l1(seq?id?no：30)、cxorf58(seq?id?no：31)、loc126068772(seq?id?no：32)、loc126069872(seq?id?no：33)、thrap3(seq?id?no：34)、cenpc1(seq?id?no：35)、dspp(seq?id?no：36)、fgf5(seq?id?no：37)、catsperg(seq?id?no：38)、myh1(seq?id?no：39)、myh13(seq?id?no：40)、atrip(seq?idno：41)和tgm3(seq?id?no：42)。還提供了分離的載體，其包含本文所述的分離的核酸序列。還提供了重組宿主細(xì)胞，其包含與以下中的至少一種具有至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％或至少99％同一性的核苷酸序列：gpr98(seq?id?no：1)、macf1(seq?id?no：2)、adarb2(seq?id?no：3)、cep290(seq?id?no：4)、krt4(seq?id?no：5)、loc126076011(seq?id?no：6)、nckap5(seq?id?no：7)、lamb4(seq?id?no：8)、npc1l1(seq?id?no：9)、adgrd2(seq?id?no：10)、ninj1(seq?id?no：11)、ahnak2(seq?idno：12)、catsperb(seq?id?no：13)、pcnxl4(seq?id?no：14)、syne2(seq?id?no：15)、nlrp12(seq?id?no：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wdr90(seq?id?no：18)、brca2(seq?idno：19)、prkdc(seq?id?no：20)、vps13b(seq?id?no：21)、psap(seq?id?no：22)、sec31b(seqid?no：23)、krt28(seq?id?no：24)、krt35(seq?id?no：25)、krt40(seq?id?no：26)、myh4(seq?id?no：27)、pirt(seq?id?no：28)、pkd1l2(seq?id?no：29)、rp1l1(seq?id?no：30)、cxorf58(seq?id?no：31)、loc126068772(seq?id?no：32)、loc126069872(seq?id?no：33)、thrap3(seq?id?no：34)、cenpc1(seq?id?no：35)、dspp(seq?id?no：36)、fgf5(seq?id?no：37)、catsperg(seq?id?no：38)、myh1(seq?id?no：39)、myh13(seq?id?no：40)、atrip(seqid?no：41)和tgm3(seq?id?no：42)。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞包含具有以下中的至少一種的核苷酸序列：gpr98(seq?id?no：1)、macf1(seq?id?no：2)、adarb2(seq?id?no：3)、cep290(seq?id?no：4)、krt4(seq?id?no：5)、loc126076011(seq?id?no：6)、nckap5(seq?idno：7)、lamb4(seq?id?no：8)、npc1l1(seq?id?no：9)、adgrd2(seq?id?no：10)、ninj1(seqid?no：11)、ahnak2(seq?id?no：12)、catsperb(seq?id?no：13)、pcnxl4(seq?id?no：14)、syne2(seq?id?no：15)、nlrp12(seq?id?no：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wdr90(seqid?no：18)、brca2(seq?id?no：19)、prkdc(seq?id?no：20)、vps13b(seq?id?no：21)、psap(seq?id?no：22)、sec31b(seq?id?no：23)、krt28(seq?id?no：24)、krt35(seq?id?no：25)、krt40(seq?id?no：26)、myh4(seq?id?no：27)、pirt(seq?id?no：28)、pkd1l2(seq?id?no：29)、rp1l1(seq?id?no：30)、cxorf58(seq?id?no：31)、loc126068772(seq?id?no：32)、loc126069872(seq?id?no：33)、thrap3(seq?id?no：34)、cenpc1(seq?id?no：35)、dspp(seqid?no：36)、fgf5(seq?id?no：37)、catsperg(seq?id?no：38)、myh1(seq?id?no：39)、myh13(seq?id?no：40)、atrip(seq?id?no：41)和tgm3(seq?id?no：42)。還提供了包含至少一種本文所述的分離的核酸序列的重組宿主細(xì)胞。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞包含2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41或42種本文所述的分離的核酸。本文還提供了重組宿主細(xì)胞，其包含在loc126071805、wash復(fù)合體亞基4(washc4)、loc126075532、loc126075533、甲胎蛋白(afp)、loc126079103、loc126079327、loc126079327、loc126080333、loc126080367、loc126080369、loc126080369、loc126080733、無遠(yuǎn)端同源盒6(dlx6)、細(xì)胞外基質(zhì)蛋白2(ecm2)、loc126085059、loc126085481、loc126086151、loc126086152、loc126086293、loc126058227、loc126058390、loc126058396、叉頭框h1(foxh1)、loc126060018、loc126060570、含卷曲螺旋結(jié)構(gòu)域蛋白15(ccdc15)、ino80復(fù)合體亞基b(ino80b)、loc126062579、loc126063153、loc126063990、loc126063991、loc126066513、loc126066877、酰基輔酶a蠟醇酰基轉(zhuǎn)移酶1(awat1)、跨膜蛋白187(tmem187)和loc126069912的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游至少一種核苷酸序列的缺失，其中：(a)loc126071805上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：43，(b)washc4上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：44，(c)loc126075532上游缺失的核酸序列包含seq?idno：45，(d)loc126075533上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：46，(e)afp上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：47，(f)loc126079103上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：48，(g)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：49，(h)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：50，(i)loc126080333上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：51，(j)loc126080367上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：52，(k)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：53，(1)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：54，(m)loc126080733上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：55，(n)dlx6上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：56，(o)ecm2上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：57，(p)loc126085059上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：58，(q)loc126085481上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：59，(r)loc126086151上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：60，(s)loc126086152上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：61，(t)loc126086293上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：62，(u)loc126058227包含seq?id?no：63，(v)loc126058390上游缺失的核酸序列包含seq?idno：64，(w)loc126058396上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：65，(x)foxh1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：66，(y)loc126060018上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：67，(z)loc126060570上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：68,(aa)ccdc15上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：69，(bb)ino80b上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：70，(cc)loc126062579上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：71，(dd)loc126063153上游缺失的核酸序列包含seqid?no：72，(ee)loc126063990上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：73，(ff)loc126063991上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：74，(gg)loc126066513上游缺失的的核酸序列包含seq?id?no：75，(hh)loc126066877上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：76，(ii)awat1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：77，(jj)tmem187上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：78，以及(kk)loc126069912上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：79。在某些實(shí)施方案中，包含本文所述的分離的核酸的重組宿主細(xì)胞還包含在loc126071805、washc4、loc126075532、loc126075533、afp、loc126079103、loc126079327、loc126079327、loc126080333、loc126080367、loc126080369、loc126080369、loc126080733、dlx6、ecm2、loc126085059、loc126085481、loc126086151、loc126086152、loc126086293、loc126058227、loc126058390、loc126058396、foxh1、loc126060018、loc126060570、ccdc15、ino80b、loc126062579、loc126063153、loc126063990、loc126063991、loc126066513、loc126066877、awat1、tmem187和loc126069912的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游至少一種核苷酸序列的缺失，其中：(a)loc126071805上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：43，(b)washc4上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：44，(c)loc126075532上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：45，(d)loc126075533上游缺失的核酸序列包含seq?idno：46，(e)afp上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：47，(f)loc126079103上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：48，(g)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：49，(h)loc1?26079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：50，(i)loc1?26080333上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：51，(j)loc126080367上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：52，(k)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：53，(l)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：54，(m)loc126080733上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：55，(n)dlx6上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：56，(o)ecm2上游缺失的核酸序列包含seq?idno：57，(p)loc126085059上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：58，(q)loc126085481上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：59，(r)loc126086151上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：60，(s)loc126086152上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：61，(t)loc126086293上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：62，(u)loc126058227包含seq?id?no：63，(v)loc126058390上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：64，(w)loc126058396上游缺失的核酸序列包含seq?idno：65，(x)foxh1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：66，(y)loc126060018上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：67，(z)loc126060570上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：68，(aa)ccdc15上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：69，(bb)ino80b上游缺失的核酸序列包含seqid?no：70，(cc)loc126062579上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：71，(dd)loc126063153上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：72，(ee)loc126063990上游缺失的核酸序列包含seqid?no：73，(ff)loc126063991上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：74，(gg)loc126066513上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：75，(hh)loc126066877上游缺失的核酸序列包含seqid?no：76，(ii)awat1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：77，(jj)tmem187上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：78，以及(kk)loc126069912上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：79。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞是干細(xì)胞。干細(xì)胞可以例如選自誘導(dǎo)干細(xì)胞、胚胎干(es)細(xì)胞或間充質(zhì)干細(xì)胞(msc)。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞是重編程細(xì)胞。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞是成纖維細(xì)胞或間充質(zhì)細(xì)胞。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞選自神經(jīng)細(xì)胞、軟骨細(xì)胞、骨細(xì)胞、肌細(xì)胞、骨細(xì)胞、脂肪細(xì)胞和表皮細(xì)胞。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞不表達(dá)gpr98、macf1、adarb2、cep290、krt4、loc126076011、nckap5、lamb4、npc1l1、adgrd2、ninj1、ahnak2、catsperb、pcnxl4、syne2、nlrp12、loc126086768、wdr90、brca2、prkdc、vps13b、psap、sec31b、krt28、krt35、krt40、myh4、pirt、pkd1l2、rp1l1、cxorf58、loc126068772、loc126069872、ihrap3、cenpc1、dspp、fgf5、caisperg、myh1、myh13、atrip和tgm3中至少一種的內(nèi)源性同源物。重組宿主細(xì)胞可以例如不表達(dá)gpr98、macf1、adarb2、cep290、krt4、loc126076011、nckap5、lamb4、npc1l1、adgrd2、ninj1、ahnak2、catsperb、pcnxl4、syne2、nlrp12、loc126086768、wdr90、brca2、prkdc、vps13b、psap、sec31b、krt28、krt35、krt40、myh4、pirt、pkd1l2、rp1l1、cxorf58、loc126068772、loc126069872、thrap3、cenpc1、dspp、fgf5、catsperg、myh1、myh13、atrip和tgm3中的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41或42種內(nèi)源性同源物。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞是大象細(xì)胞。大象細(xì)胞可以例如選自亞洲象(elephas?maximus)細(xì)胞、非洲象(loxodonta?africana)細(xì)胞、非洲森林象(loxodontacyclotis)細(xì)胞和婆羅洲象(elephas?maximus?borneensis)細(xì)胞。還提供了轉(zhuǎn)基因動物，其包含本文所述的重組宿主細(xì)胞。在某些實(shí)施方案中，轉(zhuǎn)基因動物是亞洲象(elephas?maximus)、非洲象(loxodonta?africana)、非洲森林象(loxodonta?cyclotis)或婆羅洲象(elephas?maximus?borneensis)。還提供了轉(zhuǎn)基因動物，其包含至少一種長毛猛犸象(woolly?mammoth)(真猛犸象(mammuthus?primigenius))基因變體。至少一種長毛猛犸象(真猛犸象)基因變體可以例如選自gpr98(seq?id?no：1)、macf1(seq?id?no：2)、adarb2(seq?id?no：3)、cep290(seq?idno：4)、krt4(seq?id?no：5)、loc126076011(seq?id?no：6)、nckap5(seq?id?no：7)、lamb4(seq?id?no：8)、npc1l1(seq?id?no：9)、adgrd2(seq?id?no：10)、ninj1(seq?id?no：11)、ahnak2(seq?id?no：12)、catsperb(seq?id?no：13)、pcnxl4(seq?id?no：14)、syne2(seq?idno：15)、nlrp12(seq?id?no：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wdr90(seq?id?no：18)、brca2(seq?id?no：19)、prkdc(seq?id?no：20)、vps13b(seq?id?no：21)、psap(seq?id?no：22)、sec31b(seq?id?no：23)、krt28(seq?id?no：24)、krt35(seq?id?no：25)、krt40(seq?idno：26)、myh4(seq?id?no：27)、pirt(seq?id?no：28)、pkd1l2(seq?id?no：29)、rp1l1(seqid?no：30)、cxorf58(seq?id?no：31)、loc126068772(seq?id?no：32)、loc126069872(seqid?no：33)、thrap3(seq?id?no：34)、cenpc1(seq?id?no：35)、dspp(seq?id?no：36)、fgf5(seq?id?no：37)、catsperg(seq?id?no：38)、myh1(seq?id?no：39)、myh13(seq?id?no：40)、atrip(seq?id?no：41)和tgm3(seq?id?no：42)。在某些實(shí)施方案中，轉(zhuǎn)基因動物還包含在loc126071805、washc4、loc126075532、loc126075533、afp、loc126079103、loc126079327、loc126079327、loc126080333、loc126080367、loc126080369、loc126080369、loc126080733、dlx6、ecm2、loc126085059、loc126085481、loc126086151、loc126086152、loc126086293、loc126058227、loc126058390、loc126058396、foxh1、loc126060018、loc126060570、ccdc15、ino80b、loc126062579、loc126063153、loc126063990、loc126063991、loc126066513、loc126066877、awat1、tmem187和loc126069912的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游至少一種核苷酸序列的缺失，其中：(a)loc126071805上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：43，(b)washc4上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：44，(c)loc126075532上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：45，(d)loc126075533上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：46，(e)afp上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：47，(f)loc126079103上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：48，(g)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：49，(h)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：50，(i)loc126080333上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：51，(j)loc126080367上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：52，(k)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：53，(1)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：54，(m)loc126080733上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：55，(n)dlx6上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：56，(o)ecm2上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：57，(p)loc126085059上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：58，(q)loc126085481上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：59，(r)loc126086151上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：60，(s)loc126086152上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：61，(t)loc126086293上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：62，(u)loc126058227包含seq?id?no：63，(v)loc126058390上游缺失的核酸序列包含seq?idno：64，(w)loc126058396上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：65，(x)foxh1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：66，(y)loc126060018上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：67，(z)loc126060570上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：68，(aa)ccdc15上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：69，(bb)ino80b上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：70，(cc)loc126062579上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：71，(dd)loc126063153上游缺失的核酸序列包含seqid?no：72，(ee)loc126063990上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：73，(ff)loc126063991上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：74，(gg)loc126066513上游缺失的核酸序列包含seqid?no：75，(hh)loc126066877上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：76，(ii)awat1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：77，(jj)tmem187上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：78，以及(kk)loc126069912上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：79。在某些實(shí)施方案中，轉(zhuǎn)基因動物是亞洲象(elephas?maximus)、非洲象(loxodontaafricana)、非洲森林象(loxodonta?cyclotis)或婆羅洲象(elephas?maximusborneensis)。附圖簡述當(dāng)結(jié)合所附附圖閱讀時(shí)，將更好地理解本技術(shù)的前述概述以及優(yōu)選實(shí)施方案的以下詳述。然而，應(yīng)當(dāng)理解，本技術(shù)不限于附圖中所示的精確的實(shí)施方案。圖1a-1d顯示了nckap5和ninj1替代的基因編輯實(shí)驗(yàn)的結(jié)果。圖1a是說明nckap5和ninj1替代的第一次富集的圖。圖1b是nckap5和ninj1替代的第一次富集的表。圖1c是說明nckap5和ninj1替代的第二次富集的圖。圖1d是nckap5和ninj1替代的第二次富集的表。ice得分是靶標(biāo)的敲除得分以及ki是正確猛犸象變體的敲入效率。發(fā)明詳述在背景和全部說明書中引用或描述了各種公開出版物、文章和專利，這些參考文獻(xiàn)中的每一個(gè)通過引用整體并入本文。已被包括在本說明書中的文檔、法案、材料、裝置、文章等的討論是為了提供本發(fā)明上下文的目的。這些討論不是承認(rèn)任何或所有這些事項(xiàng)形成關(guān)于所公開或要求保護(hù)的任何發(fā)明的現(xiàn)有技術(shù)的一部分。為了公開的清楚而不是作為限制，發(fā)明的詳述分為描述或說明本發(fā)明的某些特征、實(shí)施方案或應(yīng)用的子部分。定義除非另有定義，否則本文所用的所有技術(shù)和科學(xué)術(shù)語具有與本發(fā)明所屬領(lǐng)域的普通技術(shù)人員通常理解的相同含義。否則，本文所用的某些術(shù)語具有說明書中所示的含義。必須注意的是，除非上下文另有明確規(guī)定，否則如本文和所附權(quán)利要求中所用，單數(shù)形式的“一個(gè)/一種(a)”、“一個(gè)/一種(an)”和“所述”包括復(fù)數(shù)指代物。除非另有說明，否則任何數(shù)值(例如，本文所述的濃度或濃度范圍)應(yīng)被理解為在所有情況下均由術(shù)語“約”修飾。因此，數(shù)值通常包括所述值的±10％。例如，1mg/ml的濃度包括0.9mg/ml至1.1mg/ml。同樣，1％至10％(w/v)的濃度范圍包括0.9％(w/v)至11％(w/v)。如本文所用，除非上下文另有明確規(guī)定，否則數(shù)值范圍的使用明確地包括所有可能的子范圍，該范圍內(nèi)的所有單個(gè)數(shù)值(包括該范圍內(nèi)的整數(shù)和數(shù)值的分?jǐn)?shù))。除非另有規(guī)定，否則在一系列元件前的術(shù)語“至少”應(yīng)被理解為指該系列中的每個(gè)元件。本領(lǐng)域技術(shù)人員將認(rèn)識或能夠僅使用常規(guī)試驗(yàn)來確定本文所述的發(fā)明的特定實(shí)施方案的許多等同物。這種等同物旨在包括在本發(fā)明內(nèi)。如本文所用，術(shù)語“包含(comprises)”、“包含(comprising)”、“包括(includes)”、“包括(including)”、“具有(has)”、“具有(having)”“含有(contains)”或“具有(containing)”或它們的任何其它變型將被理解為暗指包括所述整體或整體的組，而不排除任何其他整體或整體的組，并且旨在是非排他性的或開放式的。例如，包含一系列要素的組合物、混合物、過程、方法、物品或設(shè)備不一定僅限于那些要素，而是可以包括未明確列出這些組合物、混合物、過程、方法、物品或設(shè)備或者這些組合物、混合物、過程、方法、物品或設(shè)備所固有的其他要素。此外，除非明確地相反說明，否則“或”是指包含性的或/和，而不是排他性的或。例如，條件a或b通過以下任一項(xiàng)滿足：a為真(或存在)且b為假(或不存在)、a為假(或不存在)且b為真(或存在)以及a和b均為真(或存在)。如本文所用，多個(gè)所述要素間的連接術(shù)語“和/或”被理解為包括單獨(dú)的和組合的選項(xiàng)。例如，當(dāng)兩個(gè)要素由“和/或”連接時(shí)，第一選項(xiàng)是指沒有第二要素的第一要素的適用。第二選項(xiàng)是指沒有第一要素的第二要素的適用。第三選項(xiàng)是指第一要素和第二要素同時(shí)適用。這些選項(xiàng)的中的任何一個(gè)被理解為落入該含義內(nèi)，并且因此滿足如本文所用的術(shù)語“和/或”的要求。多于一種選項(xiàng)的同時(shí)適用也被理解為落入該含義內(nèi)，并且因此滿足術(shù)語“和/或”的要求。如本文所用，如整個(gè)說明書和權(quán)利要求中所用的術(shù)語“由……組成(consistsof)”或其變型，例如“由……組成(consist?of)”或“由……組成(consisting?of)”表明包括任何所述整體或整體的組，但是沒有額外的整體或整體的組可以加入至特定的方法、結(jié)構(gòu)或組合物。如本文所用，如在整個(gè)說明書和權(quán)利要求中所用的術(shù)語“基本上由……組成(consists?essentially?of)”或其變型，例如“基本上由……組成(consist?essentiallyof)”或“基本上由……組成(consisting?essentially?of)”表明包括任何所述整體或整體的組，并且可選地包括本質(zhì)上不改變特定的方法、結(jié)構(gòu)或組合物的基本的或新穎的性質(zhì)的任何所述整體或整體的組。參見m.p.e.p.·§·2111.03。詞語“右”、“左”、“下”、“上”表示附圖中參考的方向。還應(yīng)當(dāng)理解，本文所用的術(shù)語“約”、“大約”、“大體上”、“基本上”及類似術(shù)語在提及優(yōu)選發(fā)明的組件的尺寸或特征時(shí)，表示所述尺寸/特征不是嚴(yán)格的界限或參數(shù)并且不排除來自它們功能上相同或相似的微小變化，如將被本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員所理解的。至少，包括數(shù)值參數(shù)的這種參考將包括使用本領(lǐng)域中接受的數(shù)學(xué)和工業(yè)原理(例如，舍入、測量或其它系統(tǒng)誤差、制造公差等)將不會改變最低有效數(shù)字的變化。術(shù)語“相同的”或“同一性”百分比在兩個(gè)或更多個(gè)核酸或多肽序列的上下文中是指當(dāng)進(jìn)行最大對應(yīng)性比較和比對時(shí)，如使用以下序列比較算法之一或通過目視檢查測量的相同的或具有特定百分比的相同的氨基酸殘基或核苷酸的兩個(gè)或更多個(gè)序列或子序列。對于序列比較，通常，一個(gè)序列作為參考序列，測試序列與其進(jìn)行比較。當(dāng)使用序列比較算法時(shí)，測試序列和參考序列輸入計(jì)算機(jī)中，指定子序列坐標(biāo)(如有必要)，并且指定序列算法程序參數(shù)。然后，序列比較算法基于指定的程序參數(shù)計(jì)算測試序列相對于參考序列的序列同一性百分比。可以例如通過以下進(jìn)行用于比較的序列的優(yōu)化比對：smith和waterman，adv.appl.math.2：482(1981)的局部同源算法，needleman和wunsch，j.mol.biol.48：443(1970)的同源比對算法，pearson和lipman,proc.nat’l.acad.sci.usa?85：2444(1988)的相似性方法檢索，這些算法的計(jì)算機(jī)化實(shí)施(wisconsin?genetics?software?package，genetics?computer?group，575science?dr.，madison,wi中的gap、bestfit、fasta和tfasta)或目視檢查(通常參見，current?protocols?in?molecular?biology，f.m.ausubel等編輯，current?protocols，greene?publishing?associates，inc.和john?wiley&sons，inc.之間的合資企業(yè)，(1995supplement)(ausubel))。適用于測定序列同一性百分比和序列相似性的算法的示例是blast和blast?2.0算法，其分別描述在altschul等，(1990)j.mol.biol.215：403-410以及altschul等，(1997)nucleic?acids?res.25：3389-3402中。進(jìn)行blast分析的軟件可通過美國國家生物技術(shù)信息中心(national?center?for?biotechnology?information)公開獲得。該算法涉及首先通過鑒定查詢序列中長度為w的短字符來鑒定高得分序列對(hsp)，當(dāng)與數(shù)據(jù)庫序列中相同長度的字符比對時(shí)，所述查詢序列長度為w的短字符匹配或滿足某個(gè)正值閾值得分t。t被稱為鄰域字符得分閾值(altschul等，同上)。這些初始鄰域字符命中作為種子，用于啟動檢索以找到包含它們的更長的hsp。然后，只要累積比對得分可以增加，沿每個(gè)序列在兩個(gè)方向延伸字符命中。對于核苷酸序列，使用參數(shù)m(匹配殘基對的獎勵(lì)得分；始終＞0)和參數(shù)n(不匹配殘基的罰罰得分；始終＜0)計(jì)算累積得分。對于氨基酸序列，使用得分矩陣計(jì)算累積得分。當(dāng)出現(xiàn)以下情況時(shí)，停止在各方向上的字符命中延伸：累積比對得分以x的量從其最大實(shí)現(xiàn)值下降；累積得分由于一個(gè)或多個(gè)負(fù)得分殘基比對的積累而變?yōu)榱慊蚋停换蛘叩竭_(dá)任一序列的末端。blast算法的參數(shù)w、t和x決定比對的靈敏度和速度。blastn程序(對于核苷酸序列)使用11的字長(w)，10的期望值(e)，m＝5，n＝-4以及兩條鏈的比較作為默認(rèn)值。對于氨基酸序列，blastp程序使用3的字長(w)，10的期望值(e)和blosum62得分矩陣(參見henikoff和henikoff,proc.natl.acad.sci.usa?89∶10915(1989))作為默認(rèn)值。除了計(jì)算序列同一性百分比外，blast算法也對兩個(gè)序列之間的相似性進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析(參見例如，karlin和altschul，proc.nar’l.acad.sci.usa?90：5873-5787(1993))。通過blast算法提供的相似性的一種測量是最小和概率(p(n))，其提供了兩個(gè)核苷酸或氨基酸序列之間偶然發(fā)生匹配的概率的指示。例如，如果測試核酸與參考核酸的比較的最小和概率小于約0.1，更優(yōu)選地小于0.01，并且最優(yōu)選地小于0.001，則認(rèn)為該核酸與參考序列相似。如下文所述，兩個(gè)核酸序列或多肽基本上相同的另一指示是由第一核酸編碼的多肽與由第二核酸編碼的多肽有免疫雜交反應(yīng)。因此，多肽通常基本上與第二多肽相同，例如其中兩條多肽僅區(qū)別于保守取代。兩個(gè)核酸序列基本上相同的另一指示是兩個(gè)分子在嚴(yán)格條件下彼此雜交。如本文所用，術(shù)語“多核苷酸”，同義地稱為“核酸分子”、“核苷酸”或“核酸”，是指任何多核糖核苷酸或多脫氧核糖核苷酸，其可以是未修飾的rna或dna或者經(jīng)修飾的rna或dna。“多核苷酸”包括但不限于單鏈dna和雙鏈dna、單鏈區(qū)和雙鏈區(qū)的混合物的dna、單鏈rna和雙鏈rna、以及單鏈區(qū)和雙鏈區(qū)的混合物的rna、包含dna和rna的雜交分子，所述dna和rna可以是單鏈的或更通常地，是雙鏈的或者是單鏈區(qū)和雙鏈區(qū)的混合物。另外，“多核苷酸”是指包含rna或dna或者rna和dna的三鏈區(qū)。術(shù)語多核苷酸還包括含有一個(gè)或多個(gè)修飾的堿基的dna或rna以及為了穩(wěn)定性或其他原因骨架被修飾的dna或rna。“經(jīng)修飾的”堿基包括，例如，三苯甲基化堿基和非尋常堿基(如肌苷)。可以對dna和rna進(jìn)行多種修飾；因此，“多核苷酸”包括通常在自然界中發(fā)現(xiàn)的化學(xué)、酶或代謝修飾形式的多核苷酸，以及病毒和細(xì)胞特征性的dna和rna的化學(xué)形式。“多核苷酸”還包括相對較短的核酸鏈，通常稱為寡核苷酸。如本文所用，術(shù)語“載體”是復(fù)制子，其中另一個(gè)核酸區(qū)段可以被可操作地插入以致引起所述區(qū)段的復(fù)制或表達(dá)。如本文所用，術(shù)語“宿主細(xì)胞”是指包含本公開的核酸分子(諸如，例如包含本發(fā)明的分離的核酸的分離的載體)的細(xì)胞。“宿主細(xì)胞”可以是任何類型的細(xì)胞，例如，原代細(xì)胞、培養(yǎng)的細(xì)胞或來自細(xì)胞系的細(xì)胞。在一個(gè)實(shí)施方案中，“宿主細(xì)胞”是用本發(fā)明的核酸分子轉(zhuǎn)染的細(xì)胞。在另一個(gè)實(shí)施方案中，“宿主細(xì)胞”是這種經(jīng)轉(zhuǎn)染的細(xì)胞的子代或潛在子代。細(xì)胞的子代可以與親本細(xì)胞相同或不同，例如，由于在隨后的世代中可能發(fā)生的突變或環(huán)境影響或核酸分子整合到宿主細(xì)胞基因組中。宿主細(xì)胞可以是例如，任何類型的原核細(xì)胞、真核細(xì)胞或古細(xì)菌細(xì)胞。在一些情況下，宿主細(xì)胞是細(xì)菌細(xì)胞。在一些情況下，宿主細(xì)胞是哺乳動物細(xì)胞。如本文所用，術(shù)語“表達(dá)”是指基因產(chǎn)物的生物合成。該術(shù)語包括基因轉(zhuǎn)錄為rna。該術(shù)語還包括rna翻譯成一條或多條多肽，并且還包括所有天然存在的轉(zhuǎn)錄后和翻譯后修飾。如本文所用，術(shù)語“肽”、“多肽”或“蛋白質(zhì)”可以指由氨基酸組成的分子并且可以由本領(lǐng)域技術(shù)人員識別為蛋白質(zhì)。本文使用了氨基酸殘基的常規(guī)單字母或三字母代碼。術(shù)語“肽”、“多肽”和“蛋白質(zhì)”在本文中可以互換使用以指任何長度的氨基酸的聚合物。該聚合物可以是線性的或支鏈的，其可以包括修飾的氨基酸并且其可以被非氨基酸中斷。該術(shù)語還包括已經(jīng)天然地或被干預(yù)修飾(例如，形成二硫鍵、糖基化、脂化、乙酰化、磷酸化或任何其他的操作或修飾，如與標(biāo)記組分結(jié)合)的氨基酸聚合物。在該定義中還包括，例如，含有一個(gè)或多個(gè)氨基酸類似物(包括例如，非天然氨基酸等)以及本領(lǐng)域已知的其他修飾的多肽。本文所述的肽序列是根據(jù)通常慣例書寫的，其中肽的n末端區(qū)在左側(cè)，以及c末端區(qū)在右側(cè)。盡管氨基酸的異構(gòu)形式是已知的，但除非另有明確說明，表示的是氨基酸的l型。術(shù)語“異源核酸”或“異源多肽”是指核酸或多肽的序列與在相同宿主細(xì)胞或相同宿主中天然發(fā)現(xiàn)的另一核酸或多肽的序列不同的核酸或多肽。如本文所用，“異源核酸”或“異源多肽”可以是細(xì)菌細(xì)胞和/或哺乳動物宿主異源的。如本文所用，術(shù)語“轉(zhuǎn)化(transform)”或“轉(zhuǎn)化(transformation)”是指將核酸片段轉(zhuǎn)移到宿主細(xì)胞(例如，宿主細(xì)菌細(xì)胞)中，導(dǎo)致遺傳穩(wěn)定的遺傳。包含轉(zhuǎn)化的核酸片段的宿主細(xì)胞被稱為“重組的”或“轉(zhuǎn)基因的”或“轉(zhuǎn)化的”生物體。如本文所用，術(shù)語“分離的”意指生物組分(例如，核酸、肽或蛋白質(zhì))已經(jīng)基本上從天然存在該組分的生物體的其他生物組分(即其他染色體、染色體外dna和rna以及蛋白質(zhì))分離、產(chǎn)生或純化。因此，已經(jīng)“分離的”核酸、肽和蛋白質(zhì)包括通過標(biāo)準(zhǔn)純化方法純化的核酸和蛋白質(zhì)。“分離的”核酸、肽、或蛋白質(zhì)可以是組合物的一部分并且如果該組合物不是核酸、肽或蛋白質(zhì)的天然環(huán)境的一部分，其仍然可以是分離的。該術(shù)語還包括通過宿主細(xì)胞中重組表達(dá)制備的核酸、肽或蛋白質(zhì)以及化學(xué)合成的核酸。如本文所用，“基因”是指包含編碼多肽的開放閱讀框的核酸，其包括外顯子以及(任選的)內(nèi)含子序列。如本文所用，“啟動子”是轉(zhuǎn)錄調(diào)控序列的示例，并且具體地是描述為位于起始密碼子的5′的基因的近端區(qū)的核酸序列。相鄰核酸區(qū)段的轉(zhuǎn)錄在啟動子區(qū)啟動。可阻遏啟動子的轉(zhuǎn)錄速率響應(yīng)阻遏劑而降低。誘導(dǎo)型啟動子的轉(zhuǎn)錄速率響應(yīng)誘導(dǎo)劑而增加。組成型啟動子的轉(zhuǎn)錄速率不是特異性調(diào)控的，盡管其可以在一般代謝的條件的影響下變化。如本文所用，術(shù)語“基因產(chǎn)物”是指由核酸序列編碼的任何產(chǎn)物。因此，基因產(chǎn)物可以，例如是初級轉(zhuǎn)錄物、成熟轉(zhuǎn)錄物、加工轉(zhuǎn)錄物或由轉(zhuǎn)錄物編碼的蛋白質(zhì)或肽。因此，基因產(chǎn)物的示例包括mrna、rrna、發(fā)夾rna(例如微小rna、shrna、sirna、trna)以及肽和蛋白質(zhì)(例如報(bào)告蛋白和治療性蛋白)如本文所用，術(shù)語“干細(xì)胞”是指可以自我更新并分化成至少一種高分化的或低發(fā)育能力的表型的細(xì)胞。術(shù)語“干細(xì)胞”包括干細(xì)胞系、誘導(dǎo)干細(xì)胞、非人胚胎干細(xì)胞、多能干細(xì)胞、專能干細(xì)胞、羊膜干細(xì)胞、胎盤干細(xì)胞或成體干細(xì)胞。“誘導(dǎo)干細(xì)胞”是這樣的細(xì)胞，其來源于通過引入一種或多種重編程因子或基因誘導(dǎo)成低分化的或高發(fā)育能力的表型的非多能細(xì)胞。該術(shù)語如本文所用，誘導(dǎo)干細(xì)胞不需要是多能的，而在適當(dāng)?shù)臈l件下具有分化成超過一種高度分化的表型的能力。應(yīng)當(dāng)理解，在引入重編程因子之前，該能力不存在。誘導(dǎo)干細(xì)胞將表達(dá)至少一種在引入重編程因子之前親本細(xì)胞不表達(dá)的干細(xì)胞標(biāo)志物。在該背景下，干細(xì)胞標(biāo)志物不包括由重編程引入的因子。誘導(dǎo)的多能干細(xì)胞或ips細(xì)胞在適當(dāng)?shù)臈l件下具有分化成源自于內(nèi)胚層、中胚層和外胚層中每一種的細(xì)胞表型的誘導(dǎo)能力。如本文所用，術(shù)語“標(biāo)志物”用于描述細(xì)胞的特征和/或表型。標(biāo)志物可以用于選擇包含目的特征的細(xì)胞并且可以隨著特定細(xì)胞而變化。標(biāo)志物是由細(xì)胞類型表達(dá)的特征或分子，無論特定細(xì)胞類型的細(xì)胞的形態(tài)學(xué)特征、結(jié)構(gòu)特征、功能特征的或生化(酶促)特征。一方面，這種標(biāo)志物是蛋白質(zhì)。這種蛋白質(zhì)可以具有本領(lǐng)域可獲得的抗體或其他結(jié)合分子的表位。然而，標(biāo)志物可以由在細(xì)胞內(nèi)或細(xì)胞上發(fā)現(xiàn)的任何分子組成，包括但不限于，蛋白質(zhì)(肽和多肽)、脂質(zhì)、多糖、核酸和類固醇。形態(tài)學(xué)特征或性狀的示例包括但不限于形狀、大小和核質(zhì)比。功能特征或性狀的示例包括但不限于結(jié)合特定物質(zhì)的能力、并入或排除特定染料的能力、在特定條件下遷移的能力以及沿著特定譜系分化的能力。標(biāo)志物可以通過本領(lǐng)域技術(shù)人員可獲得的任何方法來檢測。標(biāo)志物還可以缺乏形態(tài)學(xué)特征或缺乏蛋白質(zhì)、脂質(zhì)等。標(biāo)志物可以是存在和/或缺乏多肽和其他形態(tài)學(xué)或結(jié)構(gòu)特征的一組獨(dú)特特征的組合。在一個(gè)實(shí)施方案中，標(biāo)志物是細(xì)胞表面標(biāo)志物。術(shù)語“外源性的”是指存在于細(xì)胞中的通過人手引入的物質(zhì)。當(dāng)用于本文時(shí)，術(shù)語“外源性的”可以指通過涉及人手的過程將核酸(例如，編碼多肽的核酸)或多肽引入生物系統(tǒng)(例如，在其中不天然存在的細(xì)胞或生物體)。可選地，“外源性的”可以指通過涉及人手的過程將核酸或多肽引入生物系統(tǒng)(例如，在其中存在較低的量或希望增加細(xì)胞中或生物體中核酸或多肽的量(例如，產(chǎn)生異位表達(dá)或水平)的細(xì)胞或生物體)。如本文所用，術(shù)語“重編程基因”或“重編程因子”是指可以在體細(xì)胞中誘導(dǎo)重編程過程以重新表達(dá)低分化的、更干細(xì)胞樣的表型的試劑或核酸分子。重編程因子可以是當(dāng)其被引入細(xì)胞時(shí)促進(jìn)重編程表型的核酸、多肽或小分子。重編程因子的非限制性示例包括：oct4(八聚體結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子4)、sox2(性別決定區(qū)y)盒2、klf4(kruppel樣因子4)和c-myc。這些是所謂的用于衍生(例如誘導(dǎo)多能干細(xì)胞)的“經(jīng)典”或“標(biāo)準(zhǔn)”重編程因子組。當(dāng)引入重編程細(xì)胞為低分化或干細(xì)胞表型的過程時(shí)，可以認(rèn)為是重編程因子的額外因子包括lin28+nanog、esrrb、pax5?shrna、c/ebpa、p53?sirna、utf1、dnmt?shrna、wnt3a、sv40?lt(t)、htert，小分子化學(xué)試劑，其包括但不限于，bix-01294、bayk8644、rg108、aza、地塞米松、vpa、tsa、saha、pd0325901+chir99021(2i)和a-83-01。在一些實(shí)施方案中，重編程基因或重編程因子是oct4、klf4、sox2和c-myc。如本文所用，術(shù)語“去分化”或“逆分化(retrodifferentiation)”或“重編程”是指產(chǎn)生細(xì)胞的過程，該細(xì)胞重新表達(dá)比其來源的細(xì)胞低分化表型和/或表達(dá)在該過程之前不表達(dá)的至少一種干細(xì)胞標(biāo)志物。例如，終末分化的細(xì)胞可以去分化為專能細(xì)胞。也就是說，去分化使細(xì)胞沿著全能細(xì)胞向完全分化細(xì)胞的分化譜向后轉(zhuǎn)變。通常，細(xì)胞分化表型的逆轉(zhuǎn)需要人工操作細(xì)胞，例如，通過引入或表達(dá)外源性多肽因子。重編程通常在體內(nèi)或體外的天然條件下觀察不到。如本文所用，“重編程細(xì)胞”是已經(jīng)與一種或多種重編程因子接觸并表達(dá)比其來源的細(xì)胞低分化的表型的細(xì)胞。重編程細(xì)胞也可以具有自我更新的能力，并且將表達(dá)至少一種不作為重編程因子被遞送到細(xì)胞的干細(xì)胞標(biāo)志物。此外，重編程細(xì)胞將具有根據(jù)本文提供的或本領(lǐng)域描述的分化方案分化成高分化的體細(xì)胞類型的能力。如本文所用，術(shù)語“體細(xì)胞”是指除了生殖細(xì)胞，存在于植入前胚胎中或從植入前胚胎獲得的細(xì)胞，或由這種細(xì)胞在體外增殖產(chǎn)生的細(xì)胞之外的任何細(xì)胞。換言之，體細(xì)胞是指形成生物體機(jī)體的任何細(xì)胞，不包括生殖細(xì)胞。哺乳動物體內(nèi)的每種細(xì)胞類型(除了精子和卵子以及它們所形成的細(xì)胞(配子母細(xì)胞))是體細(xì)胞：內(nèi)臟、皮膚、骨骼、血液和結(jié)締組織都基本上由體細(xì)胞組成。在一些實(shí)施方案中，體細(xì)胞是“非胚胎體細(xì)胞”，它意指不存在于胚胎中或不是從胚胎中獲得的，并且不是由這種細(xì)胞在體外增殖產(chǎn)生的體細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，體細(xì)胞是“成體體細(xì)胞”，它意指存在于除胚胎或胎兒以外的生物體中或從除胚胎或胎兒以外的生物體中獲得的，或由這種細(xì)胞在體外增殖產(chǎn)生的細(xì)胞。表達(dá)長毛猛犸象特異性變體的核酸、載體、重組細(xì)胞和轉(zhuǎn)基因動物長毛猛犸象(真猛犸象)是大象家族的耐寒成員，其曾經(jīng)在末次冰期分布在北半球廣闊的猛犸草原，并且在大約10000年前在其大部分分布區(qū)域內(nèi)滅絕。無論是通過史前藝術(shù)還是從西伯利亞和阿拉斯加發(fā)現(xiàn)的冷凍遺骸來看，長毛猛犸象是可證明的最具特征的史前動物。這些保存完好的樣本提供了在滅絕動物中功能性地表征適應(yīng)性進(jìn)化的罕見機(jī)會。棲息極端環(huán)境，例如北緯的寒冷區(qū)，需要一系列適應(yīng)性進(jìn)化改變。長毛猛犸象樣本的遺傳和形態(tài)學(xué)分析已經(jīng)揭示了對寒冷的多種生理學(xué)適應(yīng)，包括致密的長毛發(fā)、增加的脂肪組織、減小的耳朵和尾巴以及血紅蛋白結(jié)構(gòu)的多態(tài)性。其他耐寒哺乳動物的研究已經(jīng)鑒定出相同基因和通路中的大量趨同適應(yīng)以及對共有的環(huán)境應(yīng)激因子的獨(dú)特適應(yīng)。本文所述的分離的核酸、載體、重組細(xì)胞和轉(zhuǎn)基因動物部分地基于以下發(fā)現(xiàn)細(xì)胞(例如亞洲象細(xì)胞和非洲象細(xì)胞)可以被修飾以包含和表達(dá)來自長毛猛犸象(例如，真猛犸象)的等位基因或同源物。特別地，活細(xì)胞可以被基因編輯，無論是通過轉(zhuǎn)染、轉(zhuǎn)導(dǎo)或修飾現(xiàn)有大象同源物來模擬猛犸象變體或大象基因的等位基因。在一些實(shí)施方案中，猛犸象基因的內(nèi)源性同源物被缺失或滅活。可以對大象的其它非人近緣物種(relatives)的活細(xì)胞進(jìn)行引入長毛猛犸象基因的相似修飾。猛犸象變體或等位基因可以改變基因編輯的細(xì)胞的表型。本文所述的分離的核酸、載體、重組細(xì)胞和轉(zhuǎn)基因動物提供了對于野生動物產(chǎn)物的合成替代物以及用于理解野生動物瀕危和滅絕物種的基因多樣性和細(xì)胞生物學(xué)的新工具。一方面，本文描述了編碼長毛猛犸象基因或包含內(nèi)源性基因的修飾以表達(dá)長毛猛犸象同源物或內(nèi)源性基因的變體的至少一種外源性核酸序列。特別令人感興趣的是每個(gè)經(jīng)測序的長毛猛犸象基因組所共有的基因，其不由任何經(jīng)測序的大象基因組(亞洲或非洲)所共有。通過以這種方式選擇基因，經(jīng)測序的長毛猛犸象基因組的組別中的個(gè)體變異和亞洲象和/或非洲象基因組中變異的影響被最小化以集中在完全是猛犸象的那些變異序列。鑒于此，如本文所用，“長毛猛犸象基因”、“長毛猛犸象基因變體”或“長毛猛犸象同源物”是編碼以下多肽的基因，所述多肽具有由所有經(jīng)測序的長毛猛犸象基因組所編碼的序列，并且與由所有經(jīng)測序的非洲象和亞洲象基因組所編碼的同源多肽不同。在該背景下，“與……..不同”是指相對于由非洲象和亞洲象所編碼的同源多肽具有至少一個(gè)氨基酸差異。如果至少20個(gè)核苷酸的非編碼基序存在于每個(gè)經(jīng)測序的長毛猛犸象基因組中，并且不存在于任何經(jīng)測序的亞洲象或非洲象基因組中，則非編碼或調(diào)控核酸序列可以被認(rèn)為是“長毛猛犸象序列”。由人干預(yù)修飾以編碼長毛猛犸象基因或基因變體序列的亞洲象或非洲象基因或序列是長毛猛犸象基因或基因變體，作為本文所用的術(shù)語。在本文所指的長毛猛犸象基因或基因變體是僅在長毛猛犸象基因組中發(fā)現(xiàn)編碼的，并且長毛猛犸象是滅絕的情況下，長毛猛犸象基因或基因變體序列必須對活細(xì)胞是外源的；也就是說，細(xì)胞中的序列無論通過引入外來序列或通過基因編輯外源性序列來編碼長毛猛犸象基因或基因變體序列，長毛猛犸象基因或基因變體是“外源性的”。因此，本文提供了包含長毛猛犸象(真猛犸象)基因變體的分離的核酸序列。分離的核酸序列可以例如，包含與以下中的至少一種具有至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％或至少99％同一性的核苷酸序列：g蛋白偶聯(lián)受體98(gpr98)(seq?id?no：1)、微管肌動蛋白交聯(lián)因子1(macf1)(seq?id?no：2)、腺苷脫氨酶rna特異性b2(adarb2)(seq?id?no：3)、中心體蛋白290(cep290)(seq?id?no：4)、角蛋白4(krt4)(seq?id?no：5)、loc126076011(seq?id?no：6)、nck相關(guān)蛋白5(nckap5)(seq?id?no：7)、層粘連蛋白β?4亞基(lamb4)(seq?id?no：8)、尼曼一匹克c1樣蛋白1(npc1l1)(seq?idno：9)、粘附類g蛋白偶聯(lián)受體d2(adgrd2)(seq?id?no：10)、神經(jīng)損傷誘導(dǎo)蛋白1(ninj1)(seq?id?no：11)、ahnak核蛋白2(ahnak2)(seq?id?no：12)、陽離子通道精子相關(guān)輔助亞基β(catsperb)(seq?id?no：13)、pecanex樣蛋白4(pcnxl4)(seq?id?no：14)、含血影蛋白重復(fù)序列的核膜蛋白2(syne2)(seq?id?no：15)、nlr家族含pyrin結(jié)構(gòu)域的蛋白12(nlrp12)(seqid?no：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wd重復(fù)結(jié)構(gòu)域90(wdr90)(seq?id?no：18)、乳腺癌2號(brca2)(seq?id?no：19)、蛋白激酶、dna活化催化亞基(prkdc)(seq?id?no：20)、液泡蛋白分選13同源物b(vps13b)(seq?id?no：21)、鞘脂激活蛋白原(psap)(seq?id?no：22)、sec31同源物b(sec31b)(seq?id?no：23)、角蛋白28(krt28)(seq?id?no：24)、角蛋白35(krt35)(seq?id?no：25)、角蛋白40(krt40)(seq?id?no：26)、肌球蛋白重鏈4(myh4)(seqid?no：27)、trp的磷酸肌醇相互作用調(diào)節(jié)因子(pirt)(seq?id?no：28)、多囊蛋白1樣蛋白2(pkd1l2)(seq?id?no：29)、視網(wǎng)膜色素變性1樣蛋白(rp1l1)(seq?id?no：30)、x染色體開放閱讀框58(cxorf58)(seq?id?no：31)、loc126068772(seq?id?no：32)、loc126069872(seqid?no：33)、甲狀腺激素受體相關(guān)蛋白3(thrap3)(seq?id?no：34)、著絲粒蛋白c1(cenpc1)(seq?id?no：35)、牙本質(zhì)生成和牙本質(zhì)涎磷蛋白(dspp)(seq?id?no：36)、成纖維細(xì)胞生長因子5(fgf5)(seq?id?no：37)、陽離子通道精子相關(guān)輔助亞基γ(catsperg)(seq?id?no：38)、肌球蛋白重鏈1(myh1)(seq?id?no：39)、肌球蛋白重鏈13(myh13)(seq?id?no：40)、atr相互作用蛋白(atrip)(seq?id?no：41)和轉(zhuǎn)谷氨酰胺酶3(tgm3)(seq?id?no：42)。在某些實(shí)施方案中，核苷酸序列包含以下中的至少一種：gpr98(seq?id?no：1)、macf1(seq?id?no：2)、adarb2(seq?id?no：3)、cep290(seq?id?no：4)、krt4(seq?id?no：5)、loc126076011(seq?id?no：6)、nckap5(seq?id?no：7)、lamb4(seq?id?no：8)、npc1l1(seqid?no：9)、adgrd2(seq?id?no：10)、ninj1(seq?id?no：11)、ahnak2(seq?id?no：12)、catsperb(seq?id?no：13)、pcnxl4(seq?id?no：14)、syne2(seq?id?no：15)、nlrp12(seq?idno：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wdr90(seq?id?no：18)、brca2(seq?id?no：19)、prkdc(seq?id?no：20)、vps13b(seq?id?no：21)、psap(seq?id?no：22)、sec3?1b(seq?idno：23)、krt28(seq?id?no：24)、krt35(seq?id?no：25)、krt40(seq?id?no：26)、myh4(seqid?no：27)、pirt(seq?id?no：28)、pkd1l2(seq?id?no：29)、rp1l1(seq?id?no：30)、cxorf58(seq?id?no：31)、loc126068772(seq?id?no：32)、loc126069872(seq?id?no：33)、thrap3(seq?id?no：34)、cenpc1(seq?id?no：35)、dspp(seq?id?no：36)、fgf5(seq?id?no：37)、catsperg(seq?id?no：38)、myh1(seq?id?no：39)、myh13(seq?id?no：40)、atrip(seq?idno：41)和tgm3(seq?id?no：42)。在某些實(shí)施方案中，猛犸象(真猛犸象)基因變體包含與選自seq?id?no：1-42和它們的組合的核苷酸序列具有至少80％、至少85％、至少90％或至少95％同一性的核苷酸序列。猛犸象基因變體可以例如，包含與選自seq?id?no：1-42和它們的組合的核苷酸序列具有80％、81％、82％、83％、84％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的核苷酸序列。猛犸象基因變體可以例如，包含選自seq?id?no：1-42和它們的組合的核苷酸序列。在某些實(shí)施方案中，猛犸象(真猛犸象)基因變體包含在基因的核苷酸序列中的至少一種改變。在核苷酸序列中的改變可以是例如，取代、插入、缺失或它們的組合。取代、插入、缺失或它們的組合可以例如在基因的5’非翻譯區(qū)、基因的內(nèi)含子、基因的外顯子、基因的3’非翻譯區(qū)或它們的組合。取代、插入、缺失或它們的組合可以例如在基因的調(diào)控區(qū)。還提供了分離的載體，其包含本文所述的分離的核酸序列。還提供了重組宿主細(xì)胞或轉(zhuǎn)基因動物，其包含與以下中的至少一種具有至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％或至少99％同一性的核苷酸序列：gpr98(seq?id?no：1)、macf1(seq?id?no：2)、adarb2(seq?id?no：3)、cep290(seq?id?no：4)、krt4(seq?id?no：5)、loc126076011(seq?id?no：6)、nckap5(seq?id?no：7)、lamb4(seq?id?no：8)、npc1l1(seq?id?no：9)、adgrd2(seq?id?no：10)、ninj1(seq?idno：11)、ahnak2(seq?id?no：12)、catsperb(seq?id?no：13)、pcnxl4(seq?id?no：14)、syne2(seq?id?no：15)、nlrp12(seq?id?no：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wdr90(seq?idno：18)、brca2(seq?id?no：19)、prkdc(seq?id?no：20)、vps13b(seq?id?no：21)、psap(seqid?no：22)、sec31b(seq?id?no：23)、krt28(seq?id?no：24)、krt35(seq?id?no：25)、krt40(seq?id?no：26)、myh4(seq?id?no：27)、pirt(seq?id?no：28)、pkd1l2(seq?id?no：29)、rp1l1(seq?id?no：30)、cxorf58(seq?id?no：31)、loc126068772(seq?id?no：32)、loc126069872(seq?id?no：33)、thrap3(seq?id?no：34)、cenpci(seq?id?no：35)、dspp(seqid?no：36)、fgf5(seq?id?no：37)、catsperg(seq?id?no：38)、myh1(seq?id?no：39)、myh13(seq?id?no：40)、atrip(seq?id?no：41)和tgm3(seq?id?no：42)。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞或轉(zhuǎn)基因動物包含具有以下中至少一種的核苷酸序列：gpr98(seq?id?no：1)、macf1(seq?id?no：2)、adarb2(seq?id?no：3)、cep290(seq?id?no：4)、krt4(seq?id?no：5)、loc126076011(seq?id?no：6)、nckap5(seq?id?no：7)、lamb4(seq?id?no：8)、npc1l1(seqid?no：9)、adgrd2(seq?id?no：10)、ninj1(seq?id?no：11)、ahnak2(seq?id?no：12)、catsperb(seq?id?no：13)、pcnxl4(seq?id?no：14)、syne2(seq?id?no：15)、nlrp12(seq?idno：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wdr90(seq?id?no：18)、brca2(seq?id?no：19)、prkdc(seq?id?no：20)、vps13b(seq?id?no：21)、psap(seq?id?no：22)、sec31b(seq?id?no：23)、krt28(seq?id?no：24)、krt35(seq?id?no：25)、krt40(seq?id?no：26)、myh4(seq?idno：27)、pirt(seq?id?no：28)、pkd1l2(seq?id?no：29)、rp1l1(seq?id?no：30)、cxorf58(seq?id?no：31)、loc126068772(seq?id?no：32)、loc126069872(seq?id?no：33)、thrap3(seq?id?no：34)、cenpc1(seq?id?no：35)、dspp(seq?id?no：36)、fgf5(seq?id?no：37)、catsperg(seq?id?no：38)、myh1(seq?id?no：39)、myh13(seq?id?no：40)、atrip(seq?idno：41)和tgm3(seq?id?no：42)。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞包含2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41或42種本文所述的分離的核酸。還提供了重組宿主細(xì)胞或轉(zhuǎn)基因動物，其包含至少一種本文所述的分離的核酸序列。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞或轉(zhuǎn)基因動物包含2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41或42種本文所述的分離的核酸序列。還提供了重組宿主細(xì)胞或轉(zhuǎn)基因動物，其包含在loc126071805、wash復(fù)合體亞基4(washc4)、loc126075532、loc126075533、甲胎蛋白(afp)、loc126079103、loc126079327、loc126079327、loc126080333、loc126080367、loc126080369、loc126080369、loc126080733、無遠(yuǎn)端同源盒6(dlx6)、細(xì)胞外基質(zhì)蛋白2(ecm2)、loc126085059、loc126085481、loc126086151、loc126086152、loc126086293、loc126058227、loc126058390、loc126058396、叉頭框h1(foxh1)、loc126060018、loc126060570、含卷曲螺旋結(jié)構(gòu)域蛋白15(ccdc15)、ino80復(fù)合體亞基b(ino80b)、loc126062579、loc126063153、loc126063990、loc126063991、loc126066513、loc126066877、酰基輔酶a蠟醇酰基轉(zhuǎn)移酶1(awat1)、跨膜蛋白187(tmem187)和loc126069912的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游至少一種核苷酸序列的缺失，其中：(a)loc126071805上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：43，(b)washc4上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：44，(c)loc126075532上游缺失的核酸序列包含seq?idno：45，(d)loc126075533上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：46，(e)afp上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：47，(f)loc126079103上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：48，(g)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：49，(h)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：50，(i)loc126080333上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：51，(j)loc126080367上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：52，(k)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：53，(1)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：54，(m)loc126080733上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：55，(n)dlx6上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：56，(o)ecm2上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：57，(p)loc126085059上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：58，(q)loc126085481上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：59，(r)loc126086151上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：60，(s)loc126086152上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：61，(t)loc126086293上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：62，(u)loc126058227包含seq?id?no：63，(v)loc126058390上游缺失的核酸序列包含seq?idno：64，(w)loc126058396上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：65，(x)foxh1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：66，(y)loc126060018上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：67，(z)loc126060570上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：68，(aa)ccdc15上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：69，(bb)ino80b上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：70，(cc)loc126062579上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：71，(dd)loc126063153上游缺失的核酸序列包含seqid?no：72，(ee)loc126063990上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：73，(ff)loc126063991上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：74，(gg)loc126066513上游缺失的核酸序列包含seqid?no：75，(hh)loc126066877上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：76，(ii)awat1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：77，(jj)tmem187上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：78，以及(kk)loc126069912上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：79。在某些實(shí)施方案中，包含本文所述的分離的核酸的重組宿主細(xì)胞或轉(zhuǎn)基因動物還包含在loc126071805、washc4、loc126075532、loc126075533、afp、loc126079103、loc126079327、loc126079327、loc126080333、loc126080367、loc126080369、loc126080369、loc126080733、dlx6、ecm2、loc126085059、loc126085481、loc126086151、loc126086152、loc126086293、loc126058227、loc126058390、loc126058396、foxh1、loc126060018、loc126060570、ccdc15、ino80b、loc126062579、loc126063153、loc126063990、loc126063991、loc126066513、loc126066877、awat1、tmem187和loc126069912的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游至少一種核苷酸序列的缺失，其中：(a)loc126071805上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：43，(b)washc4上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：44，(c)loc126075532上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：45，(d)loc126075533上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：46，(e)afp上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：47，(f)loc126079103上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：48，(g)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：49，(h)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：50，(i)loc126080333上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：51，(j)loc126080367上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：52，(k)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：53，(1)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：54，(m)loc126080733上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：55，(n)dlx6上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：56，(o)ecm2上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：57，(p)loc126085059上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：58，(q)loc126085481上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：59，(r)loc126086151上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：60，(s)loc126086152上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：61，(t)loc1?26086293上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：62，(u)loc126058227包含seq?idno：63，(v)loc126058390上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：64，(w)loc126058396上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：65，(x)foxh1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：66，(y)loc126060018上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：67，(z)loc126060570上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：68，(aa)ccdc15上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：69，(bb)ino80b上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：70，(cc)loc126062579上游缺失的核酸序列包含seqid?no：71，(dd)loc126063153上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：72，(ee)loc126063990上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：73，(ff)loc126063991上游缺失的核酸序列包含seqid?no：74，(gg)loc126066513上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：75，(hhh)loc126066877上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：76，(ii)awat1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：77，(jj)tmem187上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：78，以及(kk)loc126069912上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：79。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞或轉(zhuǎn)基因動物還包含在wo2022/125940(將其通過引用整體并入本文)中如表1所述的至少一種長毛猛犸象基因變體。如wo2022/125940中所述的長毛猛犸象基因變體涉及多種生物過程，包括但不限于，調(diào)控冷敏感性、調(diào)控?zé)崦舾行浴⒄{(diào)控胞內(nèi)ph、調(diào)控軸突發(fā)生和發(fā)育、trna、代謝過程、細(xì)胞粘附、組織發(fā)育和形成、基于微管的細(xì)胞運(yùn)動、生物過程的負(fù)性調(diào)控、基因表達(dá)、細(xì)胞大分子代謝過程等。本文所述的長毛猛犸象基因變體可以在如本文所述的任何重組宿主細(xì)胞或轉(zhuǎn)基因動物中表達(dá)的任何組合中使用。在一些實(shí)施方案中,由重組宿主細(xì)胞或轉(zhuǎn)基因動物包含的至少一種分離的核酸編碼gpr98(seq?id?no：1)。在一些實(shí)施方案中，由重組宿主細(xì)胞或轉(zhuǎn)基因動物包含的兩種分離的核酸編碼gpr98(seq?id?no：1)和macf1(seq?id?no：2)。在一些實(shí)施方案中，由重組宿主細(xì)胞或轉(zhuǎn)基因動物包含的三種分離的核酸編碼gpr98(seq?idno：1)、macf1(seq?id?no：2)和adarb2(seq?id?no：3)。在一些實(shí)施方案中，由重組宿主細(xì)胞或轉(zhuǎn)基因動物包含的四種分離的核酸編碼gpr98(seq?id?no：1)、macf1(seq?id?no：2)、adarb2(seq?id?no：3)和cep290(seq?id?no：4)。在一些實(shí)施方案中，由重組宿主細(xì)胞包含的5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41或42種分離的核酸編碼5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41或42種本文所述的長毛猛犸象基因變體。在一些實(shí)施方案中，所述的重組宿主細(xì)胞或轉(zhuǎn)基因動物還包含如本文所述的loc126071805、washc4、loc126075532、loc126075533、afp、loc126079103、loc126079327、loc126079327、loc126080333、loc126080367、loc126080369、loc126080369、loc126080733、dlx6、ecm2、loc1?26085059、loc126085481、loc126086151、loc126086152、loc126086293、loc126058227、loc126058390、loc126058396、foxh1、loc126060018、loc126060570、ccdc15、ino80b、loc126062579、loc126063153、loc126063990、loc126063991、loc126066513、loc126066877、awat1、tmem187和loc126069912的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游至少一種核苷酸序列的缺失。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞是亞洲象(elephas?maximus)細(xì)胞、非洲象(loxodonta?africana)細(xì)胞、非洲森林象(loxodonta?cyclotis)細(xì)胞或婆羅洲象(elephasmaximus?bomeensis)細(xì)胞。在某些實(shí)施方案中，轉(zhuǎn)基因動物是亞洲象(elephas?maximus)、非洲象(loxodontaafricana)、非洲森林象(loxodonta?cyclotis)或婆羅洲象(elephas?maximusbomeensis)。細(xì)胞本文所述的長毛猛犸象基因變體可以由可以接受外源性遺傳物質(zhì)的任何活細(xì)胞表達(dá)。細(xì)胞可以是，例如，原核細(xì)胞或真核細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，細(xì)胞是真核細(xì)胞。細(xì)胞可以是重編程細(xì)胞、非人卵母細(xì)胞、非人胚胎的細(xì)胞或非人囊胚的細(xì)胞。在任何方面的一些實(shí)施方案中，細(xì)胞是成纖維細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，細(xì)胞選自神經(jīng)細(xì)胞、軟骨細(xì)胞、骨細(xì)胞、肌細(xì)胞、骨細(xì)胞、脂肪細(xì)胞和表皮細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，細(xì)胞是預(yù)先分化成選自神經(jīng)細(xì)胞、軟骨細(xì)胞、骨細(xì)胞、肌細(xì)胞、骨細(xì)胞、脂肪細(xì)胞和表皮細(xì)胞的細(xì)胞。科學(xué)文獻(xiàn)提供了本領(lǐng)域普通技術(shù)人員分離和制備用于與本文所述的分離的核酸和載體一起使用所必需的細(xì)胞的指導(dǎo)。本文所述的細(xì)胞可以來自任何活的非人來源或生物體。通常，生物體是動物或脊椎動物，例如野生動物、動物園動物、瀕危動物、嚙齒動物、家養(yǎng)動物或鳥類。作為非限制性示例，動物可以包括，大象、河馬、蹄兔、海牛、熊、熊貓、貓科動物物種(例如，老虎、獅子、獵豹、山貓)、犬科動物物種(例如,狐貍、狼)、禽類物種(例如，鴕鳥、鴯鹋、企鵝、鴿子)和魚類(鱒魚、鯰魚和鮭魚)。在一些實(shí)施方案中，本文所述的細(xì)胞來自哺乳動物。可以得到這些細(xì)胞的生物體的非限制性示例包括：大象(例如，非洲象、亞洲象、非洲森林象、婆羅洲象)；蹄兔(例如，dendrohyrax?arboreus、dendrohyrax?dorsalis、heterohyrax?brucei、procaviacapensis)；土豚(例如，oryceteropus?afer)；鼩鼱(例如，suncus?etruscus、blarinabrevicauda、neomys?fodiens)和海牛(trichechus?inunguis、trichechus?manatus、trichechus?manatus?latirostris、trichechus?manatus?manatus、trichechussenegalensis)。在某些實(shí)施方案中，可用于本文所述的方法和組合物中的細(xì)胞是大象細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，細(xì)胞是大象成纖維細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，細(xì)胞是大象干細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，本文所述的細(xì)胞是重編程為干細(xì)胞或具有干細(xì)胞樣形態(tài)學(xué)和/或表達(dá)至少一種本文所述的干細(xì)胞標(biāo)志物的干細(xì)胞樣表型的大象體細(xì)胞。本文所述的細(xì)胞可以來自用本領(lǐng)域已知的方法分離自生物體的任何組織。例如，胎盤組織可以在幼體足月分娩之后從給定生物體(例如大象)中分離，隨后用本領(lǐng)域已知的方法處理用于細(xì)胞分離和/或培養(yǎng)。可以用于本文所述的組合物和方法的額外的示例性細(xì)胞類型包括但不限于成纖維細(xì)胞、皮膚細(xì)胞、血細(xì)胞(例如，白細(xì)胞、單核細(xì)胞、樹突狀細(xì)胞)、干細(xì)胞、造血細(xì)胞、肝細(xì)胞、血管細(xì)胞、肌細(xì)胞、胰腺細(xì)胞、神經(jīng)細(xì)胞、眼細(xì)胞或視網(wǎng)膜細(xì)胞、上皮或內(nèi)皮細(xì)胞、肺細(xì)胞、心臟細(xì)胞、腸細(xì)胞、膈肌細(xì)胞(diaphragmatic?cell)、腎(即，腎臟)細(xì)胞、骨髓細(xì)胞或者生物體的任何一種或多種選定的組織或細(xì)胞，考慮了針對其進(jìn)行遺傳修飾或基因編輯以表達(dá)長毛猛犸象基因。在某些實(shí)施方案中，本文所述的分離的核酸和載體用于干細(xì)胞。干細(xì)胞是保留了通過有絲分裂的細(xì)胞分裂而自我更新能力，并且可以分化為更特化的細(xì)胞類型的細(xì)胞。哺乳動物干細(xì)胞的三種廣泛的類型包括：存在于囊胚的胚胎干(es)細(xì)胞、從體細(xì)胞重編程的誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(ipsc)和存在于成人組織的成體干細(xì)胞。干細(xì)胞的其他來源可以包括，例如羊膜來源或胎盤來源的干細(xì)胞。多能干細(xì)胞可以分化為源自三種胚層中的任一種的細(xì)胞。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞是干細(xì)胞。干細(xì)胞可以例如，選自誘導(dǎo)干細(xì)胞、胚胎干(es)細(xì)胞或間充質(zhì)干細(xì)胞(msc)。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞是重編程細(xì)胞。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞是成纖維細(xì)胞或間充質(zhì)細(xì)胞。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞選自神經(jīng)細(xì)胞、軟骨細(xì)胞、骨細(xì)胞、肌細(xì)胞、骨細(xì)胞、脂肪細(xì)胞和表皮細(xì)胞。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞不表達(dá)gpr98、macf1、adarb2、cep290、krt4、loc126076011、nckap5、lamb4、npc1l1、adgrd2、ninj1、ahnak2、catsperb、pcnxl4、syne2、nlrp12、loc126086768、wdr90、brca2、prkdc、vps13b、psap、sec31b、krt28、krt35、krt40、myh4、pirt、pkd1l2、rp1l1、cxorf58、loc126068772、loc126069872、thrap3、cenpc1、dspp、fgf5、catsperg、myh1、myh13、atrip和tgm3中至少一種的內(nèi)源性同源物。例如，重組宿主細(xì)胞可以不表達(dá)gpr98、macf1、adarb2、cep290、krt4、loc126076011、nckap5、lamb4、npc1l1、adgrd2、ninj1、ahnak2、catsperb、pcnxl4、syne2、nlrp12、loc126086768、wdr90、brca2、prkdc、vps13b、psap、sec31b、krt28、krt35、krt40、myh4、pirt、pkd1l2、rp1l1、cxof58、loc126068772、loc126069872、thrap3、cenpc1、dspp、fgf5、catsperg、myh1、myh13、atrip和tgm3中的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41或42種內(nèi)源性同源物。在某些實(shí)施方案中，重組宿主細(xì)胞是大象細(xì)胞，大象細(xì)胞可以例如選自亞洲象(elephas?maximus)細(xì)胞、非洲象(loxodonta?africana)細(xì)胞、非洲森林象(loxodontacyclotis)細(xì)胞和婆羅洲象(elephas?maximus?borneensis)細(xì)胞。還提供了包含本文所述的重組宿主細(xì)胞的轉(zhuǎn)基因動物。在某些實(shí)施方案中，轉(zhuǎn)基因動物是亞洲象(elephas?maximus)、非洲象(loxodonta?africana)、非洲森林象(loxodonta?cyclotis)和婆羅洲象(elephas?maximus?borneensis)。轉(zhuǎn)基因動物還提供了包含至少一種長毛猛犸象(真猛犸象)基因變體的轉(zhuǎn)基因動物。至少一種長毛猛犸象(真猛犸象)基因變體可以例如選自gpr98(seq?id?no：1)、macf1(seq?id?no：2)、adarb2(seq?id?no：3)、cep290(seq?id?no：4)、krt4(seq?id?no：5)、loc126076011(seqid?no：6)、nckap5(seq?id?no：7)、lamb4(seq?id?no：8)、npc1l1(seq?id?no：9)、adgrd2(seq?id?no：10)、ninj1(seq?id?no：11)、ahnak2(seq?id?no：12)、catsperb(seq?id?no：13)、pcnxl4(seq?id?no：14)、syne2(seq?id?no：15)、nlrp12(seq?id?no：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wdr90(seq?id?no：18)、brca2(seq?id?no：19)、prkdc(seqid?no：20)、vps13b(seq?id?no：21)、psap(seq?id?no：22)、sec31b(seq?id?no：23)、krt28(seq?id?no：24)、krt35(seq?id?no：25)、krt40(seq?id?no：26)、myh4(seq?id?no：27)、pirt(seq?id?no：28)、pkd1l2(seq?id?no：29)、rp1l1(seq?id?no：30)、cxorf58(seq?idno：31)、loc126068772(seq?id?no：32)、loc126069872(seq?id?no：33)、thrap3(seq?idno：34)、cenpc1(seq?id?no：35)、dspp(seq?id?no：36)、fgf5(seq?id?no：37)、catsperg(seq?id?no：38)、myh1(seq?id?no：39)、myh13(seq?id?no：40)、atrip(seq?id?no：41)和tgm3(seq?id?no：42)。在某些實(shí)施方案中，轉(zhuǎn)基因動物包含2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41或42種猛犸象基因變體。在某些實(shí)施方案中，轉(zhuǎn)基因動物不表達(dá)gpr98(seq?id?no：1)、macf1(seq?id?no：2)、adarb2(seq?id?no：3)、cep290(seq?id?no：4)、krt4(seq?id?no：5)、loc126076011(seqid?no：6)、nckap5(seq?id?no：7)、lamb4(seq?id?no：8)、npc1l1(seq?id?no：9)、adgrd2(seq?id?no：10)、ninj1(seq?id?no：11)、ahnak2(seq?id?no：12)、catsperb(seq?id?no：13)、pcnxl4(seq?id?no：14)、syne2(seq?id?no：15)、nlrp12(seq?id?no：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wdr90(seq?id?no：18)、brca2(seq?id?no：19)、prkdc(seqid?no：20)、vps13b(seq?id?no：21)、psap(seq?id?no：22)、sec31b(seq?id?no：23)、krt28(seq?id?no：24)、krt35(seq?id?no：25)、krt40(seq?id?no：26)、myh4(seq?id?no：27)、pirt(seq?id?no：28)、pkd1l2(seq?id?no：29)、rp1l1(seq?id?no：30)、cxorf58(seq?idno：31)、loc126068772(seq?id?no：32)、loc126069872(seq?id?no：33)、thrap3(seq?idno：34)、cenpc1(seq?id?no：35)、dspp(seq?id?no：36)、fgf5(seq?id?no：37)、catsperg(seq?id?no：38)、myh1(seq?id?no：39)、myh13(seq?id?no：40)、atrip(seq?id?no：41)和tgm3(seq?id?no：42)中的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41或42種內(nèi)源性同源物。在某些實(shí)施方案中，轉(zhuǎn)基因動物還包含loc126071805、washc4、loc126075532、loc126075533、afp、loc126079103、loc126079327、loc126079327、loc126080333、loc126080367、loc126080369、loc126080369、loc126080733、dlx6、ecm2、loc126085059、loc126085481、loc126086151、loc126086152、loc126086293、loc126058227、loc126058390、loc126058396、foxh1、loc126060018、loc126060570、ccdc15、ino80b、loc126062579、loc126063153、loc126063990、loc126063991、loc126066513、loc126066877、awat1、tmem187和loc126069912的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游至少一種核苷酸序列的缺失，其中(a)loc126071805上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：43，(b)washc4上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：44，(c)loc126075532上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：45，(d)loc126075533上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：46，(e)afp上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：47，(f)loc126079103上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：48，(g)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：49，(h)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：50，(i)loc126080333上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：51，(j)loc126080367上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：52，(k)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：53，(l)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：54，(m)loc126080733上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：55，(n)dlx6上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：56，(o)ecm2上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：57，(p)loc126085059上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：58，(q)loc126085481上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：59，(r)loc126086151上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：60，(s)loc126086152上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：61，(t)loc126086293上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：62，(u)loc126058227包含seq?id?no：63，(v)loc126058390上游缺失的核酸序列包含seq?idno：64，(w)loc126058396上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：65，(x)foxh1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：66，(y)loc126060018上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：67，(z)loc126060570上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：68，(aa)ccdc15上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：69，(bb)ino80b上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：70，(cc)loc126062579上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：71，(dd)loc126063153上游缺失的核酸序列包含seqid?no：72，(ee)loc126063990上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：73，(ff)loc126063991上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：74，(gg)loc126066513上游缺失的核酸序列包含seqid?no：75，(hh)loc126066877上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：76，(ii)awat1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：77，(jj)tmem187上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：78，以及(kk)loc126069912上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：79。在某些實(shí)施方案中，轉(zhuǎn)基因動物是亞洲象(elephas?maximus)、非洲象(loxodontaafricana)、非洲森林象(loxodonta?cyclotis)或婆羅洲象(elephas?maximusborneensis)。將長毛猛犸象基因變體或調(diào)控元件的缺失引入細(xì)胞的方法在任何方面的某些實(shí)施方案中，本文所述的細(xì)胞組合物表達(dá)由具有長毛猛犸象基因變體核苷酸序列(包括但不限于，如上文和wo2022/125940的表1中所述的外源性長毛猛犸象基因變體，將wo2022/125940通過引用整體并入本文)的至少一種分離的核酸序列編碼的多肽。可以通過本領(lǐng)域已知的方法，用本文所述的分離的核酸編碼的外源的長毛猛犸象基因轉(zhuǎn)染本文所述的細(xì)胞，將本文所述的細(xì)胞與本文所述的分離的核酸編碼的外源的長毛猛犸象基因接觸，或者將本文所述的分離的核酸編碼的外源的長毛猛犸象基因施用至本文所述的細(xì)胞。在某些實(shí)施方案中，經(jīng)由載體遞送編碼長毛猛犸象基因的至少一種核酸序列。載體是設(shè)計(jì)為用于向宿主細(xì)胞的遞送或用于在不同宿主細(xì)胞之間遺傳物質(zhì)的轉(zhuǎn)移的核酸構(gòu)建體。如本文所用，載體可以是病毒性的或非病毒性的。術(shù)語“載體”包括當(dāng)與合適的控制元件結(jié)合時(shí)能夠復(fù)制并且能夠轉(zhuǎn)移遺傳物質(zhì)至細(xì)胞的任何遺傳元件。載體可以包括但不限于克隆載體、表達(dá)載體、質(zhì)粒、噬菌體、轉(zhuǎn)座子、粘粒、人工染色體、病毒、病毒顆粒等。在任何方面的一些實(shí)施方案中，載體選自：質(zhì)粒、粘粒和病毒載體。表達(dá)載體是指導(dǎo)從載體上含有的連接至轉(zhuǎn)錄調(diào)控序列的核酸序列表達(dá)rna或多肽(例如，長毛猛犸象多肽)的載體。表達(dá)的序列對于細(xì)胞將通常但不一定是異源的；引入活細(xì)胞的長毛猛犸象基因?qū)τ诩?xì)胞是異源的。表達(dá)載體可以包含額外的元件，例如，表達(dá)載體可以具有兩個(gè)復(fù)制系統(tǒng)，因此允許其在兩種生物體中(例如，在用于表達(dá)的動物細(xì)胞中以及在用于克隆和擴(kuò)增的原核宿主中)維持。“表達(dá)”是指參與產(chǎn)生r?na和蛋白質(zhì)以及適當(dāng)情況下分泌蛋白質(zhì)的細(xì)胞過程，在適用的情況下包括但不限于，例如，轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄物加工、翻譯和蛋白質(zhì)折疊、修飾和加工。“表達(dá)產(chǎn)物”包括從基因轉(zhuǎn)錄的rna以及由從基因轉(zhuǎn)錄的mrna翻譯而獲得的多肽。在一些實(shí)施方案中，載體能夠驅(qū)動一個(gè)或多個(gè)序列在哺乳動物細(xì)胞中的表達(dá)；即，載體是哺乳動物表達(dá)載體。哺乳動物表達(dá)載體的示例包括pcdm8(seed，1987.nature?329：840)和pmt2pc(kaufman等，1987.emboj.6：187-195)。當(dāng)用于哺乳動物細(xì)胞時(shí)，表達(dá)載體的控制功能通常由一種或多種調(diào)控元件來提供。例如，常用的啟動子源于多瘤病毒、腺病毒2型、巨細(xì)胞病毒、猿猴病毒40以及本文公開的和本領(lǐng)域已知的其他病毒。對于用于原核和真核細(xì)胞的其他合適的表達(dá)系統(tǒng)，參見例如sambrook，等，molecular?cloning：a?laboratorymanual.第二版，cold?spring?harbor?laboratory，cold?spring?harbor?laboratorypress，cold?spring?harbor,n.y.，1989中的第16章和第17章。抑制或編輯內(nèi)源性基因表達(dá)的方法在任何方面的一些實(shí)施方案中，本文所述的細(xì)胞不表達(dá)本文所述的至少一種長毛猛犸象基因變體的內(nèi)源性同源物。在任何方面的另一個(gè)實(shí)施方案中，細(xì)胞被編輯以抑制至少一種長毛猛犸象基因變體的內(nèi)源性同源物的表達(dá)。在任何方面的另一個(gè)實(shí)施方案中，細(xì)胞被編輯以改變調(diào)控區(qū)和/或編碼區(qū)以摻入取代，使得內(nèi)源性同源物與至少一種長毛猛犸象基因變體相似。在任何方面的另一個(gè)實(shí)施方案中，外源性核酸序列的非長毛猛犸象同源物已經(jīng)被缺失或滅活。本文考慮到，當(dāng)遞送一種或多種長毛猛犸象基因變體至宿主細(xì)胞時(shí)，修飾一種或多種基因的內(nèi)源性非長毛猛犸象同源物以使一種或多種內(nèi)源性基因不發(fā)揮功能可能是有利的。本文還考慮到，如果遞送兩種或更多種長毛猛犸象基因至宿主細(xì)胞，一種或兩種內(nèi)源性宿主細(xì)胞基因?qū)淖儭Ｒ虼耍谠摫尘跋拢拗骷?xì)胞可以包含相應(yīng)的長毛猛犸象基因的至少一種非功能性內(nèi)源性同源物。在大象細(xì)胞的背景下，待表達(dá)的一種或多種長毛猛犸象基因的大象同源物將被變化、缺失或抑制，使得僅一種或多種長毛猛犸象基因由細(xì)胞表達(dá)。這可以例如，通過靶序列的標(biāo)準(zhǔn)基因編輯來實(shí)現(xiàn)。還考慮到，除了簡單地滅活內(nèi)源性基因，還可以進(jìn)行內(nèi)源性基因的大規(guī)模替代，例如經(jīng)由同源重組或經(jīng)由非猛犸象同源基因的選擇性編輯以編碼和表達(dá)猛犸象變體基因序列。靶序列可以由本領(lǐng)域已知的方法確定。例如，可以使用序列比對工具來比較長毛猛犸象核酸序列和宿主生物體中的核酸序列，例如，使用ncbi基本局部比對序列工具(blast)、orthomam、ensembl和/或megalign(dnastar)軟件。本領(lǐng)域技術(shù)人員可以確定用于比對序列的適當(dāng)參數(shù)，包括在所比較的序列的全長上實(shí)現(xiàn)最大比對所需的任何算法。抑制宿主細(xì)胞中基因功能的方法是本領(lǐng)域已知的。基因敲低、抑制和改變的非限制性示例包括，例如基因編輯酶、轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物核酸酶(talens)、抑制性核酸等。抑制性核酸的類型的非限制性實(shí)施方案可以包括，例如sirna、shrna、mirna和/或mirna，其為本領(lǐng)域已知的。本領(lǐng)域普通技術(shù)人員可以設(shè)計(jì)和測試靶向本文所述的袋狼(thylacine)基因變體的內(nèi)源性同源物的抑制劑。制備和遞送基因編輯系統(tǒng)的方法描述在例如wo2015/013583?a2；美國專利號10,640,789?b2；美國公開號us2019/0367948?a1；美國公開號2017/0266320?a1；美國公開號2018/0171361?a1；美國公開號2016/0175462?a1；和美國公開號2018/0195089?a1中，其中的每一個(gè)的內(nèi)容通過引用整體并入本文。實(shí)施方案本發(fā)明還提供了以下非限制性實(shí)施方案。實(shí)施方案1是分離的核酸序列，其包含編碼氨基酸序列的核苷酸序列，其與以下中的至少一種具有至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％或至少99％同一性：g蛋白偶聯(lián)受體98(gpr98)(seq?id?no：1)、微管肌動蛋白交聯(lián)因子1(macf1)(seq?id?no：2)、腺苷脫氨酶rna特異性b2(adarb2)(seq?id?no：3)、中心體蛋白290(cep290)(seq?id?no：4)、角蛋白4(krt4)(seq?id?no：5)、loc126076011(seq?id?no：6)、nck相關(guān)蛋白5(nckap5)(seq?id?no：7)、層粘連蛋白β?4亞基(lamb4)(seq?id?no：8)、尼曼-匹克c1樣蛋白1(npc1l1)(seq?id?no：9)、粘附類g蛋白偶聯(lián)受體d2(adgrd2)(seq?id?no：10)、神經(jīng)損傷誘導(dǎo)蛋白1(ninj1)(seq?id?no：11)、ahnak核蛋白2(ahnak2)(seq?id?no：12)、陽離子通道精子相關(guān)輔助亞基β(catsperb)(seq?id?no：13)、pecanex樣蛋白4(pcnxl4)(seq?id?no：14)、含血影蛋白重復(fù)序列的核膜蛋白2(syne2)(seq?id?no：15)、nlr家族含pyrin結(jié)構(gòu)域的蛋白12(nlrp12)(seq?id?no：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wd重復(fù)結(jié)構(gòu)域90(wdr90)(seq?id?no：18)、乳腺癌2號(brca2)(seq?id?no：19)、蛋白激酶、dna活化催化亞基(prkdc)(seq?id?no：20)、液泡蛋白分選13同源物b(vps13b)(seq?id?no：21)、鞘脂激活蛋白原(psap)(seq?id?no：22)、sec31同源物b(sec31b)(seq?id?no：23)、角蛋白28(krt28)(seq?id?no：24)、角蛋白35(krt35)(seq?id?no：25)、角蛋白40(krt40)(seqid?no：26)、肌球蛋白重鏈4(myh4)(seq?id?no：27)、trp的磷酸肌醇相互作用調(diào)節(jié)因子(pirt)(seq?id?no：28)、多囊蛋白1樣蛋白2(pkd1l2)(seq?id?no：29)、視網(wǎng)膜色素變性1樣蛋白(rp1l1)(seq?id?no：30)、x染色體開放閱讀框58(cxorf58)(seq?id?no：31)、loc126068772(seq?id?no：32)、loc126069872(seq?id?no：33)、甲狀腺激素受體相關(guān)蛋白3(thrap3)(seq?id?no：34)、著絲粒蛋白c1(cenpc1)(seq?id?no：35)、牙本質(zhì)生成和牙本質(zhì)涎磷蛋白(dspp)(seq?id?no：36)、成纖維細(xì)胞生長因子5(fgf5)(seq?id?no：37)、陽離子通道精子相關(guān)輔助亞基γ(catsperg)(seq?id?no：38)、肌球蛋白重鏈1(myh1)(seq?id?no：39)、肌球蛋白重鏈13(myh13)(seq?id?no：40)、atr相互作用蛋白(atrip)(seq?id?no：41)和轉(zhuǎn)谷氨酰胺酶3(tgm3)(seq?id?no：42)。實(shí)施方案2是實(shí)施方案1的分離的核酸序列，其中所述核苷酸序列編碼以下中的至少一種的氨基酸：gpr98(seq?id?no：1)、macf1(seq?id?no：2)、adarb2(seq?id?no：3)、cep290(seq?id?no：4)、krt4(seq?id?no：5)、loc126076011(seq?id?no：6)、nckap5(seq?idno：7)、lamb4(seq?id?no：8)、npc1l1(seq?id?no：9)、adgrd2(seq?id?no：10)、ninj1(seqid?no：11)、ahnak2(seq?id?no：12)、catsperb(seq?id?no：13)、pcnxl4(seq?id?no：14)、syne2(seq?id?no：15)、nlrp12(seq?id?no：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wdr90(seqid?no：18)、brca2(seq?id?no：19)、prkdc(seq?id?no：20)、vps13b(seq?id?no：21)、psap(seq?id?no：22)、sec31b(seq?id?no：23)、krt28(seq?id?no：24)、krt35(seq?id?no：25)、krt40(seq?id?no：26)、myh4(seq?id?no：27)、pirt(seq?id?no：28)、pkd1l2(seq?id?no：29)、rp1l1(seq?id?no：30)、cxorf58(seq?id?no：31)、loc126068772(seq?id?no：32)、loc126069872(seq?id?no：33)、thrap3(seq?id?no：34)、cenpc1(seq?id?no：35)、dspp(seqid?no：36)、fgf5(seq?id?no：37)、catsperg(seq?id?no：38)、myhl(seq?id?no：39)、myh13(seq?id?no：40)、atrip(seq?id?no：41)和tgm3(seq?id?no：42)。實(shí)施方案3是分離的載體，其包含實(shí)施方案1或2所述的分離的核酸序列。實(shí)施方案4是重組宿主細(xì)胞，其包含至少一種實(shí)施方案1或2所述的分離的核酸序列。實(shí)施方案5是重組宿主細(xì)胞，其包含與以下中的至少一種具有至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％或至少99％同一性的核苷酸序列：gpr98(seq?id?no：1)、macf1(seq?id?no：2)、adarb2(seq?id?no：3)、cep290(seq?idno：4)、krt4(seq?id?no：5)、loc126076011(seq?id?no：6)、nckap5(seq?id?no：7)、lamb4(seq?id?no：8)、npc1l1(seq?id?no：9)、adgrd2(seq?id?no：10)、ninj1(seq?id?no：11)、ahnak2(seq?id?no：12)、catsperb(seq?id?no：13)、pcnxl4(seq?id?no：14)、syne2(seq?idno：15)、nlrp12(seq?id?no：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wdr90(seq?id?no：18)、brca2(seq?id?no：19)、prkdc(seq?id?no：20)、vps13b(seq?id?no：21)、psap(seq?id?no：22)、sec31b(seq?id?no：23)、krt28(seq?id?no：24)、krt35(seq?id?no：25)、krt40(seq?idno：26)、myh4(seq?id?no：27)、pirt(seq?id?no：28)、pkd1l2(seq?id?no：29)、rp1l1(seqid?no：30)、cxorf58(seq?id?no：31)、loc126068772(seq?id?no：32)、loc126069872(seqid?no：33)、thrap3(seq?id?no：34)、cenpc1(seq?id?no：35)、dspp(seq?id?no：36)、fgf5(seq?id?no：37)、catsperg(seq?id?no：38)、myh1(seq?id?no：39)、myh13(seq?id?no：40)、atrip(seq?id?no：41)和tgm3(seq?id?no：42)。實(shí)施方案6是實(shí)施方案5所述的重組宿主細(xì)胞，其中所述宿主細(xì)胞包含具有以下中的至少一種的核苷酸序列：gpr98(seq?id?no：1)、macf1(seq?id?no：2)、adarb2(seq?idno：3)、cep290(seq?id?no：4)、krt4(seq?id?no：5)、loc126076011(seq?id?no：6)、nckap5(seq?id?no：7)、lamb4(seq?id?no：8)、npc1l1(seq?id?no：9)、adgrd2(seq?id?no：10)、ninj1(seq?id?no：11)、ahnak2(seq?id?no：12)、catsperb(seq?id?no：13)、pcnxl4(seq?idno：14)、syne2(seq?id?no：15)、nlrp12(seq?id?no：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wdr90(seq?id?no：18)、brca2(seq?id?no：19)、prkdc(seq?id?no：20)、vps13b(seq?id?no：21)、psap(seq?id?no：22)、sec31b(seq?id?no：23)、krt28(seq?id?no：24)、krt35(seq?idno：25)、krt40(seq?id?no：26)、myh4(seq?id?no：27)、pirt(seq?id?no：28)、pkd1l2(seqid?no：29)、rp1l1(seq?id?no：30)、cxorf58(seq?id?no：31)、loc126068772(seq?id?no：32)、loc126069872(seq?id?no：33)、thraap3(seq?id?no：34)、cenpc1(seq?id?no：35)、dspp(seq?id?no：36)、fgf5(seq?id?no：37)、catsperg(seq?id?no：38)、myh1(seq?id?no：39)、myh13(seq?id?no：40)、atrip(seq?id?no：41)和tgm3(seq?id?no：42)。實(shí)施方案7是實(shí)施方案4至6中任一項(xiàng)所述的重組宿主細(xì)胞，其中所述重組宿主細(xì)胞包含2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41或42種權(quán)利要求1或2所述的分離的核酸。實(shí)施方案8是重組宿主細(xì)胞，其包含在loc126071805、wash復(fù)合體亞基4(washc4)、loc126075532、loc126075533、甲胎蛋白(afp)、loc126079103、loc126079327、loc126079327、locl26080333、loc126080367、loc126080369、loc126080369、loc126080733、無遠(yuǎn)端同源盒6(dlx6)、細(xì)胞外基質(zhì)蛋白2(ecm2)、loc126085059、loc126085481、loc126086151、loc126086152、loc126086293、loc126058227、loc126058390、loc126058396、叉頭框h1(foxh1)、loc126060018、loc126060570、含卷曲螺旋結(jié)構(gòu)域蛋白15(ccdc15)、ino80復(fù)合體亞基b(ino80b)、loc126062579、loc126063153、loc126063990、loc126063991、loc126066513、loc126066877、酰基輔酶a蠟醇酰基轉(zhuǎn)移酶1(awat1)、跨膜蛋白187(tmem187)和loc126069912的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游至少一種核苷酸序列的缺失，其中：(a)loc126071805上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：43，(b)washc4上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：44，(c)loc126075532上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：45，(d)loc126075533上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：46，(e)afp上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：47，(f)loc126079103上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：48，(g)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：49，(h)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：50，(i)loc126080333上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：51，(j)loc126080367上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：52，(k)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：53，(1)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：54，(m)loc126080733上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：55，(n)dlx6上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：56，(o)ecm2上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：57，(p)loc126085059上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：58，(q)loc126085481上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：59，(r)loc126086151上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：60，(s)loc126086152上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：61，(t)loc126086293上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：62，(u)loc126058227包含seq?id?no：63，(v)loc126058390上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：64，(w)loc126058396上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：65，(x)foxh1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：66，(y)loc126060018上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：67，(z)loc126060570上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：68，(aa)ccdc15上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：69，(bb)ino80b上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：70，(cc)loc126062579上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：71，(dd)loc126063153上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：72，(ee)loc126063990上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：73，(ff)loc126063991上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：74，(gg)loc126066513上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：75，(hh)loc126066877上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：76，(ii)awat1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：77，(jj)tmem187上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：78，以及(kk)loc126069912上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：79。實(shí)施方案9是實(shí)施方案7所述的重組宿主細(xì)胞，其還包含在loc126071805、washc4、loc126075532、loc126075533、afp、loc126079103、loc126079327、loc126079327、loc126080333、loc126080367、loc126080369、loc126080369、loc126080733、dlx6、ecm2、loc126085059、loc126085481、loc126086151、loc126086152、loc126086293、loc126058227、loc126058390、loc126058396、foxh1、loc126060018、loc126060570、ccdc15、ino80b、loc126062579、loc126063153、loc126063990、loc126063991、loc126066513、loc126066877、awat1、tmem187和loc126069912的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游至少一種核苷酸序列的缺失，其中：(a)loc126071805上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：43，(b)washc4上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：44，(c)loc126075532上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：45，(d)loc126075533上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：46，(e)afp上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：47，(f)loc126079103上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：48，(g)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：49，(h)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：50，(i)loc126080333上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：51，(j)loc126080367上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：52，(k)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：53，(1)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：54，(m)loc126080733上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：55，(n)dlx6上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：56，(o)ecm2上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：57，(p)loc1?26085059上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：58，(q)loc1126085481上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：59，(r)loc126086151上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：60，(s)loc126086152上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：61，(t)loc126086293上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：62，(u)loc126058227包含seq?id?no：63，(v)loc126058390上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：64，(w)loc126058396上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：65，(x)foxh1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：66，(y)loc126060018上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：67，(z)loc126060570上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：68，(aa)ccdc1?5上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：69，(bb)ino80b上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：70，(cc)loc126062579上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：71，(dd)loc126063153上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：72，(ee)loc126063990上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：73，(ff)loc126063991上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：74，(gg)loc126066513上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：75，(hh)loc1?26066877上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：76，(ii)awat1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：77，(jj)tmem187上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：78，以及(kk)loc126069912上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：79。實(shí)施方案10是實(shí)施方案4至9中任一項(xiàng)所述的重組宿主細(xì)胞，其中所述重組宿主細(xì)胞是干細(xì)胞。實(shí)施方案11是實(shí)施方案10所述的重組宿主細(xì)胞，其中所述干細(xì)胞選自誘導(dǎo)干細(xì)胞、胚胎干(es)細(xì)胞或間充質(zhì)干細(xì)胞(msc)。實(shí)施方案12是實(shí)施方案4至9中任一項(xiàng)所述的重組宿主細(xì)胞，其中所述重組宿主細(xì)胞是重編程細(xì)胞。實(shí)施方案13是實(shí)施方案4至9中任一項(xiàng)所述的重組宿主細(xì)胞，其中所述重組宿主細(xì)胞是成纖維細(xì)胞或間充質(zhì)細(xì)胞。實(shí)施方案14是實(shí)施方案4至9中任一項(xiàng)所述的重組宿主細(xì)胞，其中所述重組宿主細(xì)胞選自神經(jīng)細(xì)胞、軟骨細(xì)胞、骨細(xì)胞、肌細(xì)胞、骨細(xì)胞、脂肪細(xì)胞和表皮細(xì)胞。實(shí)施方案15是實(shí)施方案4至14中任一項(xiàng)所述的重組宿主細(xì)胞，其中所述重組宿主細(xì)胞不表達(dá)gpr98、macf1、adarb2、cep290、krt4、loc126076011、nckap5、lamb4、npc1l1、adgrd2、ninj1、ahnak2、catsperb、pcnxl4、syne2、nlrp12、loc126086768、wdr90、brca2、prkdc、vps13b、psap、sec31b、krt28、krt35、krt40、myh4、pirt、pkd1l2、rp1l1、cxorf58、loc126068772、loc126069872、thrap3、cenpci、dspp、fgf5、catsperg、myh1、myh13、atrip和tgm3中至少一種的內(nèi)源性同源物。實(shí)施方案16是實(shí)施方案15所述的重組宿主細(xì)胞，其中所述重組宿主細(xì)胞不表達(dá)gpr98、macf1、adarb2、cep290、krt4、loc126076011、nckap5、lamb4、npc1l1、adgrd2、ninj1、ahnak2、catsperb、pcnxl4、syne2、nlrp12、loc126086768、wdr90、brca2、prkdc、vps13b、psap、sec31b、krt28、krt35、krt40、myh4、pirt、pkd1l2、rp1l1、cxorf58、loc126068772、loc126069872、thrap3、cenpc1、dspp、fgf5、catsperg、myh1、myh13、atrip和tgm3中的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41或42種內(nèi)源性同源物。實(shí)施方案17是實(shí)施方案3至16中任一項(xiàng)所述的重組宿主細(xì)胞，其中所述重組宿主細(xì)胞是大象細(xì)胞。實(shí)施方案18是實(shí)施方案17所述的重組宿主細(xì)胞，其中所述大象細(xì)胞選自亞洲象(elephas?maximus)細(xì)胞、非洲象(loxodonta?afrricana)細(xì)胞、非洲森林象(loxodontacyclotis)細(xì)胞和婆羅洲象(elephas?maximus?borneensis)細(xì)胞。實(shí)施方案19是包含實(shí)施方案3至18中任一項(xiàng)所述的重組宿主細(xì)胞的轉(zhuǎn)基因動物。實(shí)施方案20是實(shí)施方案19所述的轉(zhuǎn)基因動物，其中所述轉(zhuǎn)基因動物是亞洲象(elephas?maximus)、非洲象(loxodonta?africana)、非洲森林象(loxodonta?cyclotis)和婆羅洲象(elephas?maximus?borneensis)。實(shí)施方案21是包含至少一種長毛猛犸象(真猛犸象)基因變體的轉(zhuǎn)基因動物。實(shí)施方案22是實(shí)施方案21所述的轉(zhuǎn)基因動物，其中至少一種長毛猛犸象(真猛犸象)基因變體包含編碼氨基酸序列的核苷酸序列，其與以下中的至少一種具有至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％或至少99％同一性：gpr98(seqid?no：1)、macf1(seq?id?no：2)、adarb2(seq?id?no：3)、cep290(seq?id?no：4)、krt4(seqid?no：5)、loc126076011(seq?id?no：6)、nckap5(seq?id?no：7)、lamb4(seq?id?no：8)、npc1l1(seq?id?no：9)、adgrd2(seq?id?no：10)、ninj1(seq?id?no：11)、ahnak2(seq?idno：12)、catsperb(seq?id?no：13)、pcnxl4(seq?id?no：14)、syne2(seq?id?no：15)、nlrp12(seq?id?no：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wdr90(seq?id?no：18)、brca2(seq?idno：19)、prkdc(seq?id?no：20)、vps13b(seq?id?no：21)、psap(seq?id?no：22)、sec31b(seqid?no：23)、krt28(seq?id?no：24)、krt35(seq?id?no：25)、krt40(seq?id?no：26)、myh4(seq?id?no：27)、pirt(seq?id?no：28)、pkd1l2(seq?id?no：29)、rp1l1(seq?id?no：30)、cxorf58(seq?id?no：31)、loc126068772(seq?id?no：32)、loc1?26069872(seq?id?no：33)、thrap3(seq?id?no：34)、cenpc1(seq?id?no：35)、dspp(seq?id?no：36)、fgf5(seq?id?no：37)、catsperg(seq?id?no：38)、myh1(seq?id?no：39)、myh13(seq?id?no：40)、atrip(seqid?no：41)和tgm3(seq?id?no：42)。實(shí)施方案23是實(shí)施方案22所述的轉(zhuǎn)基因動物，其中所述至少一種長毛猛犸象(真猛犸象)基因變體包含以下中的至少一種：gpr98(seq?id?no：1)、macf1(seq?id?no：2)、adarb2(seq?id?no：3)、cep290(seq?id?no：4)、krt4(seq?id?no：5)、loc126076011(seq?idno：6)、nckap5(seq?id?no：7)、lamb4(seq?id?no：8)、npc1l1(seq?id?no：9)、adgrd2(seqid?no：10)、ninj1(seq?id?no：11)、ahnak2(seq?id?no：12)、catsperb(seq?id?no：13)、pcnxl4(seq?id?no：14)、syne2(seq?id?no：15)、nlrp12(seq?id?no：16)、loc126086768(seq?id?no：17)、wdr90(seq?id?no：18)、brca2(seq?id?no：19)、prkdc(seq?id?no：20)、vps13b(seq?id?no：21)、psap(seq?id?no：22)、sec31b(seq?id?no：23)、krt28(seq?id?no：24)、krt35(seq?id?no：25)、krt40(seq?id?no：26)、myh4(seq?id?no：27)、pirt(seq?idno：28)、pkd1l2(seq?id?no：29)、rp1l1(seq?id?no：30)、cxorf58(seq?id?no：31)、loc126068772(seq?id?no：32)、loc126069872(seq?id?no：33)、thrap3(seq?id?no：34)、cenpc1(seq?id?no：35)、dspp(seq?id?no：36)、fgf5(seq?id?no：37)、catsperg(seq?idno：38)、myh1(seq?id?no：39)、myh13(seq?id?no：40)、atrip(seq?id?no：41)和tgm3(seqid?no：42)。實(shí)施方案24是實(shí)施方案21至23中任一項(xiàng)所述的轉(zhuǎn)基因動物，其中所述轉(zhuǎn)基因動物包含2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41或42種長毛猛犸象(真猛犸象)基因變體。實(shí)施方案25是實(shí)施方案21至24中任一項(xiàng)所述的轉(zhuǎn)基因動物，其中所述轉(zhuǎn)基因動物還包含在loc126071805、wash復(fù)合體亞基4(washc4)、loc126075532、loc126075533、甲胎蛋白(afp)、loc126079103、loc126079327、loc126079327、loc126080333、loc126080367、loc126080369、loc126080369、loc126080733、無遠(yuǎn)端同源盒6(dlx6)、細(xì)胞外基質(zhì)蛋白2(ecm2)、loc126085059、loc126085481、loc126086151、loc126086152、loc126086293、loc126058227、loc126058390、loc126058396、叉頭框h1(foxh1)、loc126060018、loc126060570、含卷曲螺旋結(jié)構(gòu)域蛋白15(ccdc15)、ino80復(fù)合體亞基b(ino80b)、loc126062579、loc126063153、loc126063990、loc126063991、loc126066513、loc126066877、酰基輔酶a蠟醇酰基轉(zhuǎn)移酶1(awat1)、跨膜蛋白187(tmem187)和loc126069912的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游至少一種核苷酸序列的缺失，其中：(a)loc126071805上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：43，(b)washc4上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：44，(c)loc126075532上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：45，(d)loc126075533上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：46，(e)afp上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：47，(f)loc126079103上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：48，(g)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：49，(h)loc126079327上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：50，(i)loc126080333上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：51，(j)loc126080367上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：52，(k)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：53，(l)loc126080369上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：54，(m)loc126080733上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：55，(n)dlx6上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：56，(o)ecm2上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：57，(p)loc126085059上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：58，(q)loc126085481上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：59，(r)loc126086151上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：60，(s)loc126086152上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：61，(t)loc126086293上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：62，(u)loc126058227包含seq?id?no：63，(v)loc126058390上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：64，(w)loc126058396上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：65，(x)foxh1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：66，(y)loc126060018上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：67，(z)loc126060570上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：68，(aa)ccdc15上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：69，(bb)ino80b上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：70，(cc)loc126062579上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：71，(dd)loc126063153上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：72，(ee)loc126063990上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：73，(ff)loc126063991上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：74，(gg)loc126066513上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：75，(hh)loc126066877上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：76，(ii)awat1上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：77，(jj)tmem187上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：78，以及(kk)loc126069912上游缺失的核酸序列包含seq?id?no：79。實(shí)施方案26是實(shí)施方案21至25中任一項(xiàng)所述的轉(zhuǎn)基因動物，其中所述轉(zhuǎn)基因動物不表達(dá)gpr98、macf1、adarb2、cep290、krt4、loc126076011、nckap5、lamb4、npc1l1、adgrd2、ninj1、ahnak2、catsperb、pcnxl4、syne2、nlrp12、loc126086768、wdr90、brca2、prkdc、vps13b、psap、sec31b、krt28、krt35、krt40、myh4、pirt、pkd1l2、rp1l1、cxorf58、loc126068772、loc126069872、thrap3、cenpc1、dspp、fgf5、catsperg、myh1、myh13、atrip和tgm3中至少一種的內(nèi)源性同源物。實(shí)施方案27是實(shí)施方案26所述的轉(zhuǎn)基因動物，其中所述轉(zhuǎn)基因動物不表達(dá)gpr98、macf1、adarb2、cep290、krt4、loc126076011、nckap5、lamb4、npc1l1、adgrd2、ninj1、ahnak2、catsperb、pcnxl4、syne2、nlrp12、loc126086768、wdr90、brca2、prkdc、vps13b、psap、sec31b、krt28、krt35、krt40、myh4、pirt、pkd1l2、rp1l1、cxorf58、loc126068772、loc126069872、thrap3、cenpc1、dspp、fgf5、catsperg、myh1、myh13、atrip和tgm3中的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41或42種內(nèi)源性同源物。實(shí)施方案28是實(shí)施方案21至27中任一項(xiàng)所述的轉(zhuǎn)基因動物，其中所述轉(zhuǎn)基因動物是大象。實(shí)施方案29是實(shí)施方案28所述的轉(zhuǎn)基因動物，其中所述大象選自亞洲象(elephasmaximus)、非洲象(loxodonta?africana)、非洲森林象(loxodonta?cyclotis)和婆羅洲象(elephas?maximus?borneensis)。實(shí)施例實(shí)施例1：長毛猛犸象變體的鑒定使用melemax1參考基因組鑒定了46頭長毛猛犸象、12頭亞洲象和27頭非洲象的變體。使用adapterremoval1或fastp修剪讀取，以修剪讀取的低質(zhì)量(qual<25)末端并去除＜35bp的讀取。使用(minikraken2_v2_8gb_201904)kraken預(yù)編譯數(shù)據(jù)庫，用0.8的置信度的kraken來檢測污染物。使用bwa?aln(種子為16,500，最大編輯距離為0.01以及最大空位開放為2)將未分類修剪的讀數(shù)與參考基因組比對。使用paleomix2(猛犸象樣品)和picardmarkduplicates(大象樣品)來任選的標(biāo)記重復(fù)讀取。使用samtools3來合并來自由多次運(yùn)行產(chǎn)生的相同樣品的二進(jìn)制比對圖譜(binary?alignment?map，bam)。使用qualimap4、damageprofiler5和multiqc6來評估比對質(zhì)量。用以下工具samtools/bcftools3和gatk47來檢測種系變異。使用glnexus8來測定gvcf文件的基因分型。使用snpeff9來測定變異效應(yīng)。如果在亞洲象和非洲象樣品以及在亞洲象重復(fù)區(qū)和cpg島區(qū)均觀察到變體，則將其過濾。鑒定了猛犸象固定變體，并且確定的是，猛犸象固定變體必須(i)在具有讀取深度＞5的所謂基因型的所有長毛猛犸象中是純合子；(ii)在亞洲象和非洲象中觀察不到；(iii)不在重復(fù)區(qū)或cpg島區(qū)中。創(chuàng)建了melemax1?siftdb。用siftdb注釋錯(cuò)義變異來預(yù)測效果。根據(jù)在至少5頭猛犸象中發(fā)現(xiàn)的錯(cuò)義變異的sift得分之和將基因進(jìn)行排序。使用segalign10在來自ucsc的亞洲象參考基因組melemax1和人參考基因組hg38之間產(chǎn)生成對的全基因組比對。用這種成對的比對，使用crossmap區(qū)域來轉(zhuǎn)換幾個(gè)公開可獲得的數(shù)據(jù)集的基因組坐標(biāo)。從ucsc中下載了hg38中的tf簇，一種encode?3調(diào)控軌道(129種細(xì)胞類型中340種tf的轉(zhuǎn)錄因子chip-seq簇)12-14。從ucsc中還下載了hg38和mm10中來自ncbi?refseq功能性元件和encode?ccre(候選順式調(diào)控元件)的數(shù)據(jù)14,15。對于小鼠基因組mm10，重復(fù)這些步驟。結(jié)果是在源自人和小鼠中的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的亞洲象基因組中的假定調(diào)控元件的數(shù)據(jù)集。然后，使用bedtools來相交以鑒定與固定猛犸象基因變體重疊的假定的調(diào)控區(qū)16。接下來，用bedtools?closest來鑒定每個(gè)假定的調(diào)控區(qū)的最接近的melemax1基因16。然后，針對鄰近最近基因的2kb內(nèi)過濾這些調(diào)控區(qū)。根據(jù)數(shù)據(jù)分析，在長毛猛犸象基因組中鑒定了不存在于比較的大象基因組中的一系列編碼蛋白質(zhì)的基因變體。表1中提供了編碼蛋白質(zhì)的長毛猛犸象基因變體。表1：編碼蛋白質(zhì)的基因變體另外，在長毛猛犸象基因組中鑒定了不存在于比較的大象基因組中的調(diào)控元件變體(即缺失)的集合。表2中提供了調(diào)控靶標(biāo)變體。表2：調(diào)控元件變體實(shí)施例2：fgf5的靶向編輯fgf5編碼fgf家族中的蛋白質(zhì)，其參與胚胎發(fā)育、細(xì)胞生長和組織修復(fù)以及其他生物學(xué)功能。該基因經(jīng)由在毛囊周期中促進(jìn)從生長期至退行期的運(yùn)動而與毛發(fā)伸長的抑制作用密切關(guān)聯(lián)。fgf5與毛發(fā)發(fā)育密切相關(guān)，尤其是在生長期-退行期的毛囊周期連接中。由于單個(gè)核苷酸缺失以及隨后的過早終止密碼子形成導(dǎo)致該蛋白質(zhì)的截短變體的突變與多種物種的非特征性長毛發(fā)的表型表現(xiàn)有關(guān)。這似乎主要僅影響某些毛發(fā)類型(即在兔子的絨毛和在人中的面部毛發(fā))。該截短的蛋白質(zhì)沒有與有害的發(fā)育表型特異地相關(guān)。crispr(諸如，例如crispr-cas9或crispr-cas12)可以用于敲除待編輯細(xì)胞中的fgf5。crispr(諸如，例如crispr-cas9或crispr-cas12)系統(tǒng)可以包含具有以下序列的靶向?qū)蛐蛄校簍gaggaaagaagcaggaggg(seq?id?no：80)。編輯亞洲象(elephas?maximus)細(xì)胞以在fgf5中摻入插入缺失(indel)。fgf5的破壞涉及多種生物學(xué)過程，包括胚胎發(fā)育、細(xì)胞生長、形態(tài)發(fā)生、組織修復(fù)、腫瘤生長和侵襲。該基因被鑒定為癌基因，其在轉(zhuǎn)染至哺乳動物細(xì)胞時(shí)賦予轉(zhuǎn)化潛力。小鼠中該基因的同源物的靶向破壞導(dǎo)致異常長毛發(fā)的表型，這表明其作為毛發(fā)伸長的抑制劑的功能。已經(jīng)鑒定了編碼不同同種型的可變剪接轉(zhuǎn)錄本變體。經(jīng)由在猛犸象與大象基因組比較中觀察到的snp位點(diǎn)的基于敲除機(jī)制的方法諸如，例如crispr(諸如，例如crispr-cas9或crispr-cas12)的基因編輯預(yù)期會導(dǎo)致fgf5的截短變體。由于促進(jìn)毛囊從生長期向退行期的運(yùn)動的系統(tǒng)能力降低，預(yù)期對這種被破壞的基因的表型反應(yīng)是具有顯著伸長的毛發(fā)的生物體。實(shí)施例3：替代ninj1和nckap5基因并且經(jīng)由rnp和ssodn測試attb位點(diǎn)的整合效率轉(zhuǎn)染試劑根據(jù)需要在冰上解凍以下試劑：(a)編輯器alt-rtm?s.p.cas9核酸酶v3蛋白(1mg/ml)，alt-rtma.s.cas12a(1mg/ml)或質(zhì)粒編輯器；(b)grna：溶解在15μl無核酸酶的水中的100μm?sgrna(synthego；redwood?city，ca)；(c)供體：同源定向修復(fù)(hdr)供體質(zhì)粒或線性dsdna(經(jīng)pcr純化的)；(d)alt-rtm?hdr-增強(qiáng)子v2；(e)pifithrin-α(p53抑制劑)。確定rnp緩沖液和轉(zhuǎn)染比色皿的位置，并且rnp緩沖液和轉(zhuǎn)染比色皿包括以下：(a)p3原代細(xì)胞nucleofectortmm溶液(lonzatm?p3原代細(xì)胞4d-nucleofectortm?x試劑盒l(wèi)(lonza試劑盒；lonza；basel，switzerland))；(b)補(bǔ)充緩沖液1(lonza)；以及(c)100μl?nucleofectortm(lonza)。制備的轉(zhuǎn)染試劑通過將相同體積的alt-rtm?s.p.cas9核酸酶v3蛋白(1mg/ml)、100μm?sgrna和無核酸酶的水組合至少十分鐘，進(jìn)行編輯蛋白與sg?rna的雜交以形成cas9核糖核蛋白(rnp)。因?yàn)榫庉嫷鞍讓Σ煌膕grna序列具有不同的親和力，所以每種sgrna或crrna獨(dú)立地雜交。使用標(biāo)準(zhǔn)體積的2.5μl的每種試劑，除了nckap5，其中3.33μl和1.67μl用于每種rnp，以補(bǔ)償rnp之間的效率差異。制備p3/s1緩沖液(82％p3，18％s1)。該緩沖液用于在轉(zhuǎn)染前直接重懸細(xì)胞。使用2.5μg中量制備的(midi-prepped)hdr供體質(zhì)粒。制備p3/s1緩沖液(82％p3，18％s1)。該緩沖液用于在轉(zhuǎn)染前直接重懸細(xì)胞。100μl的p3/s1緩沖液用于單個(gè)反應(yīng)。基于質(zhì)粒的編輯反應(yīng)計(jì)算加入至編輯反應(yīng)的質(zhì)粒體積的等式如下：質(zhì)粒體積(μl)＝所需質(zhì)粒的量(ng)/質(zhì)粒濃度(ng/μl)。基于質(zhì)粒的編輯反應(yīng)試劑不需要孵育并且在加入至細(xì)胞之前將供體與編輯器和grna混合。轉(zhuǎn)染反應(yīng)在轉(zhuǎn)染前，細(xì)胞是健康的、生長的并且接近匯合。將至少500,000個(gè)細(xì)胞，理想地1,000,000個(gè)細(xì)胞或更多個(gè)用于每個(gè)轉(zhuǎn)染反應(yīng)。使用facs富集具有替代的細(xì)胞。為了制備用于轉(zhuǎn)染的細(xì)胞，使用與真空壓力和無菌的非過濾吸頭(nonfilteredtip)連接的2ml血清移液管從細(xì)胞中吸除培養(yǎng)基。在1x?pbs中洗滌細(xì)胞，來回?fù)u動以完全覆蓋細(xì)胞。然后，從細(xì)胞中吸除1x?pbs，然后，再次在1x?pbs中洗滌細(xì)胞。將0.25％胰蛋白酶直接加入至細(xì)胞中，將培養(yǎng)皿來回?fù)u動以完全覆蓋。細(xì)胞在胰蛋白酶中孵育2-3分鐘，同時(shí)在37℃，5％co2下?lián)u動，并使用顯微鏡檢查完全釋放。將等體積的1：1培養(yǎng)基加入至細(xì)胞中以中和胰蛋白酶，并且將細(xì)胞等分至管中用于離心。細(xì)胞以300xg離心10min。通過加入5ml的1：1培養(yǎng)基、1μl的pifithrin-α以及7.14μl的alt-rtm?hdr-增強(qiáng)子v2以制備t25培養(yǎng)瓶。從離心的細(xì)胞中移除上清液，并且用1ml的1∶1培養(yǎng)基重懸細(xì)胞。對于每個(gè)樣品，將10μl的重懸細(xì)胞加入至10μl的臺盼藍(lán)中，并且通過加入10μl至細(xì)胞計(jì)數(shù)器中對該細(xì)胞計(jì)數(shù)。剩余的細(xì)胞以300xg離心10min，移除上清液，并將細(xì)胞在p3/s1緩沖液中重懸。將導(dǎo)向序列/編輯器/水的預(yù)混合物和hdr供體加入至p3/s1重懸的細(xì)胞中至100μl的總體積。將100μl加入至100ul的大比色皿中，并使用lonza?nucleofector來轉(zhuǎn)染細(xì)胞。將轉(zhuǎn)染的細(xì)胞轉(zhuǎn)移至t25培養(yǎng)瓶中并將另外的100μl的1∶1培養(yǎng)基從培養(yǎng)瓶加入至培養(yǎng)皿中，并將剩余的細(xì)胞轉(zhuǎn)移至培養(yǎng)瓶。將培養(yǎng)瓶孵育24小時(shí)，并且僅用1：1培養(yǎng)基更換培養(yǎng)基。1∶1標(biāo)準(zhǔn)生長培養(yǎng)基的制備組合以下物質(zhì)并過濾滅菌得到1升的“1：1培養(yǎng)基”：300ml的ham’s?f12(thermofisher?scientific，waltham，ma)、200ml的hi?fbs(thermo?fisher)、5ml的2mm?glutamax(thermo?fisher)、5ml的100x?neaa(thermo?fisher)、5ml的100x?anti/anti(thermofisher)、50μl的100ng/μl?bfgf(stemcell?technologies，vancouver，bc，canada)、50μ1的100μg/μl?egf(stemcell?technologies)、1ml的55mm?bme(thermo?fisher)、5μl的50mg/ml抗壞血酸(sigma-aldrich，burlington，ma)、500ml的egm-2bullet試劑盒培養(yǎng)基(lonza，walkersville，md)以及egm-2bullet試劑盒補(bǔ)充物(lonza)。通過facs富集的細(xì)胞群進(jìn)行facs以富集穩(wěn)定熒光蛋白(例如gfp)表達(dá)的細(xì)胞群。瞬時(shí)表達(dá)通常在轉(zhuǎn)染后7天完成，并且轉(zhuǎn)染超過8天的熒光蛋白表達(dá)通常代表穩(wěn)定的整合體。對于facs富集，通過加入1：1培養(yǎng)基和經(jīng)過濾的fbs培養(yǎng)基的1：1的混合物，建立平板用于接受分選的細(xì)胞樣品。如下文所述產(chǎn)生細(xì)胞團(tuán)塊。在冰上分選樣品，并與組織培養(yǎng)板一起直接轉(zhuǎn)運(yùn)至facs設(shè)施。將細(xì)胞分選至平板中。將分選的平板直接轉(zhuǎn)運(yùn)回培養(yǎng)箱中用于培養(yǎng)。在第二天檢查細(xì)胞以確認(rèn)群體貼壁和擴(kuò)增。記錄通過率和所用的過濾器。對于96孔板和384孔板，在轉(zhuǎn)染后的前5天不需要更換培養(yǎng)基。在第五天，以及直到細(xì)胞傳代或孔充滿的每2至3天，將1：1的培養(yǎng)基直接加入至孔中而不需要更換培養(yǎng)基，以在細(xì)胞脫離培養(yǎng)基之前給予細(xì)胞更多的時(shí)間在富含pbs的培養(yǎng)基中。序列驗(yàn)證在上述提供了沉淀細(xì)胞的步驟后，將少于1,000,000個(gè)細(xì)胞且多于20,000個(gè)細(xì)胞沉淀用于最佳的細(xì)胞裂解。去除上清，并且將細(xì)胞在-20℃冷凍以繼續(xù)裂解/dna提取。對于裂解和dna提取，分別通過將蛋白質(zhì)降解劑(life?sciences，gene?artgenomic?cleavage?kit)和快速提取dna提取溶液(quick?extract?dna?extractionsolution)以1μl/25μl的比例組合來制備裂解儲備緩沖液。將裂解緩沖液加入至含有干燥和解凍的細(xì)胞團(tuán)塊的管中。將細(xì)胞團(tuán)塊渦旋10-15秒。將內(nèi)容物轉(zhuǎn)移至管中并置于65℃加熱塊或熱循環(huán)儀上6分鐘。將管渦旋10-15秒，然后轉(zhuǎn)移至98℃加熱塊上2分鐘。裂解樣品并使用5μl或更少的裂解物用于隨后的pcr反應(yīng)中。用pcr的基因分型替代用于第一輪pcr的引物是用在同源臂外側(cè)的一個(gè)引物以及在報(bào)告基因插入位置之前與基因組/供體基因座結(jié)合的第二個(gè)引物來設(shè)計(jì)的。設(shè)計(jì)用于替代的每一端的巢式pcr的引物，使得在第二輪pcr的情況下，所有變體和切割位點(diǎn)都可以被用于pcr反應(yīng)和sanger測序。推薦q5聚合酶以改進(jìn)序列質(zhì)量并為了改進(jìn)的長范圍pcr擴(kuò)增。高濃度和高質(zhì)量的dna是優(yōu)選的。對于pcr1反應(yīng)混合物，將20μl的含有以下物質(zhì)的反應(yīng)混合物混合：(a)10μl高保真dna聚合酶(2x)；0.2μl正向引物以及0.2μl反向引物(10μm)；(c)1μl每種細(xì)胞裂解物；(d)用無核酸酶的水補(bǔ)足至20μl。對于每個(gè)獨(dú)特編輯的擴(kuò)增子，制備陽性對照。還制備了沒有細(xì)胞裂解物的陰性對照。對于pcr1反應(yīng)，在熱循環(huán)儀中使用以下條件：105℃熱蓋溫度；20μl體積：1x?98℃保持2分鐘；20x：98℃保持10秒，引物特異性退火溫度保持30秒，72℃保持約30秒/千堿基的dna；1x72℃保持30秒/千堿基；4℃無限保持。使pcr產(chǎn)物在凝膠上顯現(xiàn)。對于pcr2反應(yīng)混合物，將30μl的含有以下物質(zhì)的反應(yīng)混合物混合：(a)15μl高保真dna聚合酶(2x)；0.3μl正向引物以及0.3μl反向引物(10μm)；(c)1μl的第一輪的pcr產(chǎn)物；(d)用無核酸酶的水補(bǔ)足至30μl。對于每個(gè)獨(dú)特編輯的擴(kuò)增子，制備陽性對照。還制備了沒有無模板的陰性對照，其具有無dna加入的第1輪pcr產(chǎn)物。對于pcr2反應(yīng)，在熱循環(huán)儀中使用以下條件：105℃熱蓋溫度；30μl體積：1x?98℃保持2分鐘；20x：98℃保持10秒，引物特異性退火溫度保持15秒，72℃保持約30秒/千堿基的dna；1x?4℃無限保持；保存pcr產(chǎn)物用于sanger測序。對來自第1輪和10x?pcr反應(yīng)的pcr產(chǎn)物進(jìn)行凝膠驗(yàn)證。提交樣品進(jìn)行sanger測序。記錄不具有超過50的crl或大于30的qs的任何樣品。將序列與靶序列比對并且目視檢查文件以確保它們與預(yù)期的位置進(jìn)行比對，并檢查質(zhì)量或覆蓋范圍中的其它潛在問題。根據(jù)在線可獲取的模板和說明書進(jìn)行synthego?ice分析。克隆分離和冷凍保存(cryobanking)基于序列驗(yàn)證，通過驗(yàn)證所期望的編輯存在以及具有那種編輯的群體的百分比，確定是否需要進(jìn)一步的富集。對于驗(yàn)證具有不需要進(jìn)一步富集的期望編輯的樣品，重復(fù)用于克隆分離和富集群體和以上所述的基因分型的步驟。對于驗(yàn)證具有期望的編輯且不需要進(jìn)一步富集的樣品，將樣品擴(kuò)增并作為經(jīng)修飾的細(xì)胞系進(jìn)行冷凍保存。編輯檢查點(diǎn)、克隆性生長以及基于wgs的中靶/脫靶擴(kuò)增經(jīng)修飾的細(xì)胞系并且用于重復(fù)應(yīng)用。一旦進(jìn)行了超過5個(gè)驗(yàn)證的編輯，分配至少1x106個(gè)細(xì)胞用于wgs分析以測定中靶/脫靶。對于制備wgs樣品，將細(xì)胞以300xg離心并去除上清液。然后將細(xì)胞團(tuán)塊用液氮快速凍存，并在液氮條件下儲存。結(jié)論在相同的細(xì)胞系中順序地進(jìn)行ninj1和nckap5基因的基因替代，并且對于這些細(xì)胞系的第一次和第二次富集的插入缺失和敲入得分顯示在圖1a至1d中。該方法成功地產(chǎn)生了這樣的細(xì)胞系：基于親本系的基因分型，該細(xì)胞系在ninj1和nckap5基因中對于所有預(yù)期的猛犸象特異性取代具有大約20％替代。本領(lǐng)域技術(shù)人員將明白，在不背離其廣泛的發(fā)明概念下，可以對實(shí)施方案進(jìn)行改變。因此，應(yīng)該理解本發(fā)明不限于所公開的特定實(shí)施方案，而是旨在涵蓋如本說明書所限定的本發(fā)明的精神和范圍內(nèi)的修改。參考文獻(xiàn)1.schubert,m.,lindgreen,s.&orlando,l.adapterremoval?v2:rapid?adaptertrimming,identification,and?read?merging.bmc?res.notes?9,88(2016).2.schubert,m.et?al.characterization?of?ancient?and?modem?genomes?bysnp?detection?and?phylogenomic?and?metagenomic?analysis?usingpaleomix.nat.protoc.9,1056-1082(2014).3.li,h.et?al.?the?sequence?alignment/map?format?andsamtools.bioinformatics?25,2078-2079(2009).4.garcía-alcalde,f.et?al.qualimap:evaluating?next-generationsequencing?alignment?data.bioinformatics?28,2678-2679(2012).5.j?ónsson,h.,ginolhac,a.,schubert,m.,johnson,p.l.f.&orlando,l.mapdamage2.0:fast?approxi?mate?bayesian?estimates?of?ancient?dna?damageparameters.bioinformatics?29,1682-1684(2013).6.ewels,p.,magnusson,m.,lundin,s.&m.multiqc:summarize?analysisresults?for?multiple?tools?and?samples?in?a?single?report.bioinformatics?32,3047-3048(2016).7.mckenna,a.et?al.the?genome?analysis?toolkit:a?mapreduce?frameworkfor?analyzing?next-generation?dna?sequencing?data.genome?res.20,1297-1303(2010).8.lin,m.f.et?al.glnexus：joint?variant?calling?for?large?cohortsequencing.http://biorxiv.org/lookup/doi/10.1101/343970(2018)doi:10.1101/343970.9.cingolani,p.et?al.a?program?for?annotating?and?predicting?theeffects?of?single?nucleotide?polymorphisms,snpeff.fly(austin)6,80-92(2012).10.goenka,s.d.,turakhia,y.,paten,b.&horowitz,m.segalign：a?scalablegpu-based?whole?genome?aligner.in?sc20:international?conference?for?highperformance?computing,net?working,storage?and?analysis?1-13(ieee,2020).doi:10.1109/sc41405.2020.00043.11.zhao,h.et?al?crossmap:a?versatile?tool?for?coordinate?conversionbetween?genome?assemblies.bioinformatics?30,1006-1007(2014).12.encode?project?consortium.an?integrated?encyclopedia?of?dnaelements?in?the?human?genome.nature?489,57-74(2012).13.luo,y.et?al.new?developments?on?the?encyclopedia?of?dna?elements(encode)data?portal.nucleic?acids?res.48,d882-d889(2020).14.the?encode?project?consortium?et?al.expanded?encyclopaedias?of?dnaelements?in?the?human?and?mouse?genomes.nature?583,699-710(2020).15.pruitt,k.d.et?al.refseq:an?update?on?mammalian?referencesequences.nucleic?acids?res.42,d756-763(2014).16.quinlan,a.r.&hall,i.m.bedtools:a?flexible?suite?of?utilities?forcomparing?genomic?features.bioinformatics?26,841-842(2010).
背景技術(shù)：
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路